Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 33

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	14938847	A-G	HET
SBS	Chr1	18485249	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g33590
SBS	Chr1	35041404	T-A	HET
SBS	Chr1	35041405	T-A	HET
SBS	Chr1	35193998	C-T	HET
SBS	Chr1	38641455	T-A	HET
SBS	Chr2	15360595	A-T	Homo
SBS	Chr2	19773660	C-T	HET
SBS	Chr2	20261804	G-A	HET
SBS	Chr2	32395222	A-G	Homo
SBS	Chr3	17070707	A-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g29950
SBS	Chr4	2163939	G-T	HET
SBS	Chr4	5722884	C-A	HET
SBS	Chr4	10934008	G-A	HET
SBS	Chr4	16412181	C-T	HET
SBS	Chr4	29881865	C-T	HET
SBS	Chr4	33800261	T-A	HET
SBS	Chr5	2068828	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g04480
SBS	Chr5	15700655	T-C	HET
SBS	Chr5	20858651	C-T	HET
SBS	Chr5	29493156	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g51430
SBS	Chr6	8035680	A-T	HET
SBS	Chr6	8067014	T-C	HET
SBS	Chr6	30967258	T-A	Homo
SBS	Chr8	5291224	C-T	HET
SBS	Chr9	11658711	A-G	HET
SBS	Chr9	13442446	A-T	HET	STOP_GAINED	LOC_Os09g22220
SBS	Chr10	5029651	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g09300
SBS	Chr10	8825271	A-T	HET
SBS	Chr10	17103356	G-T	Homo	STOP_GAINED	LOC_Os10g32649
SBS	Chr11	21074471	C-T	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g35880
SBS	Chr12	8405630	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g14680
SBS	Chr12	24951181	T-A	HET

Deletions: 9

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Deletion	Chr10	315499	315502	3
Deletion	Chr12	5124150	5124160	10
Deletion	Chr12	9106956	9106958	2
Deletion	Chr5	10622104	10622105	1
Deletion	Chr4	14156125	14156129	4
Deletion	Chr4	14464006	14464007	1
Deletion	Chr9	14970430	14970437	7
Deletion	Chr8	15171857	15171948	91
Deletion	Chr11	18045584	18045588	4

Insertions: 6

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr3	2454206	2454209	4
Insertion	Chr6	1309350	1309351	2
Insertion	Chr5	6362961	6362962	2
Insertion	Chr5	11146288	11146288	1
Insertion	Chr8	21890634	21890634	1
Insertion	Chr11	12087570	12089310	1741

Inversions: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr2	34566281	34742308

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr11	22168661	Chr8	16178857	2
Translocation	Chr7	22208108	Chr6	353722
Translocation	Chr11	24337231	Chr2	3897892
Translocation	Chr11	27820948	Chr5	23587093	2

Main menu