Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 35

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	29091717	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g50650
SBS	Chr1	31906338	G-A	HET
SBS	Chr1	40458821	C-T	HET
SBS	Chr1	40984288	C-T	HET
SBS	Chr2	8845839	C-A	Homo
SBS	Chr2	23796952	G-A	Homo
SBS	Chr2	28694934	A-T	Homo
SBS	Chr2	28694939	G-T	Homo
SBS	Chr3	9905618	A-T	HET
SBS	Chr4	2859023	G-T	HET
SBS	Chr4	8962499	T-A	HET
SBS	Chr4	15959283	T-C	HET
SBS	Chr4	17390417	G-A	HET
SBS	Chr4	21420847	C-T	HET
SBS	Chr4	26699473	A-T	HET
SBS	Chr5	25978934	G-C	HET
SBS	Chr7	12733520	C-A	Homo	STOP_GAINED	LOC_Os07g22620
SBS	Chr7	12991131	T-A	Homo
SBS	Chr7	21550109	T-G	HET
SBS	Chr8	15806355	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g25970
SBS	Chr8	16126253	G-A	HET
SBS	Chr9	5675838	T-A	HET
SBS	Chr9	8825775	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g14820
SBS	Chr9	12271308	A-T	HET
SBS	Chr9	12271321	A-G	HET
SBS	Chr10	11067224	A-T	Homo
SBS	Chr10	12883599	A-G	HET
SBS	Chr10	14615530	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g28150
SBS	Chr10	19430165	G-A	Homo
SBS	Chr11	22727731	C-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g38370
SBS	Chr12	5145823	G-A	HET
SBS	Chr12	9370373	A-T	HET
SBS	Chr12	15746588	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g26860
SBS	Chr12	17325310	G-A	HET
SBS	Chr12	23605810	T-C	HET

Deletions: 9

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	4530110	4530111	1
Deletion	Chr6	6087001	6099000	11999	2
Deletion	Chr3	7934282	7934284	2
Deletion	Chr6	16760304	16760307	3
Deletion	Chr5	21064562	21064565	3
Deletion	Chr4	29551232	29551348	116
Deletion	Chr4	32338335	32338340	5
Deletion	Chr4	33732653	33732668	15
Deletion	Chr1	36614284	36614288	4

Insertions: 5

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr4	19484078	19484080	3	LOC_Os04g32470
Insertion	Chr4	15065348	15065348	1
Insertion	Chr4	24563484	24563729	246
Insertion	Chr6	13729281	13729281	1
Insertion	Chr7	21078750	21078751	2

No Inversion

Translocations: 11

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr8	112584	Chr5	21294965	LOC_Os05g35910
Translocation	Chr9	4757291	Chr8	10071806
Translocation	Chr10	8053110	Chr7	15100151	LOC_Os10g15210
Translocation	Chr5	8562072	Chr1	40306313
Translocation	Chr4	10726462	Chr3	21207041	LOC_Os03g38190
Translocation	Chr11	11360873	Chr6	20569078
Translocation	Chr11	11508165	Chr8	19974189	2
Translocation	Chr3	13643951	Chr1	2804236	LOC_Os01g05850
Translocation	Chr6	14879839	Chr1	8713314	LOC_Os06g25420
Translocation	Chr4	23938474	Chr3	5772805
Translocation	Chr12	27080746	Chr6	8332724

Main menu