Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 57

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Gene Affected
SBS	Chr1	6870388	A-G	HET
SBS	Chr1	10582134	C-G	HET
SBS	Chr1	26341144	C-G	HET
SBS	Chr1	29408440	T-A	HET
SBS	Chr2	3957880	C-T	HET
SBS	Chr2	15011956	T-C	HET
SBS	Chr2	24844906	T-A	HOMO
SBS	Chr3	2294185	T-C	HET
SBS	Chr3	2294188	G-A	HET
SBS	Chr3	13059985	G-A	HET
SBS	Chr3	15642110	A-T	HET
SBS	Chr3	21218817	A-G	HET
SBS	Chr3	22946502	G-T	HET
SBS	Chr3	29340404	C-T	HOMO
SBS	Chr4	8596865	A-C	HET
SBS	Chr4	11214051	A-G	HET
SBS	Chr4	20646362	A-G	HET
SBS	Chr4	22315537	C-T	HET	LOC_Os04g37460
SBS	Chr4	28397283	C-T	HOMO
SBS	Chr4	28401365	G-C	HOMO
SBS	Chr5	549462	C-T	HET
SBS	Chr5	953989	C-T	HET
SBS	Chr5	2654491	A-G	HOMO
SBS	Chr5	20432524	G-C	HOMO
SBS	Chr5	20525622	T-C	HET
SBS	Chr5	29468480	G-T	HET
SBS	Chr7	3622985	C-G	HOMO
SBS	Chr7	8151732	T-C	HET
SBS	Chr7	8383949	C-A	HET
SBS	Chr7	9527773	C-T	HET
SBS	Chr7	10488315	C-A	HET
SBS	Chr7	24722935	C-A	HET	LOC_Os07g41250
SBS	Chr8	2591248	A-C	HET
SBS	Chr8	7419029	C-A	HET
SBS	Chr8	7745669	G-A	HET
SBS	Chr8	10705283	G-T	HET	LOC_Os08g17480
SBS	Chr8	16006587	A-G	HET
SBS	Chr9	6727755	A-C	HOMO	LOC_Os09g11950
SBS	Chr9	14563689	G-A	HET
SBS	Chr9	16911051	G-T	HET
SBS	Chr9	18368537	A-T	HOMO
SBS	Chr10	1726349	G-T	HET
SBS	Chr10	8623690	A-T	HET	LOC_Os10g17170
SBS	Chr10	11567370	T-A	HET
SBS	Chr10	11852717	C-T	HOMO
SBS	Chr10	12417322	C-T	HET
SBS	Chr10	21326305	C-T	HET
SBS	Chr10	22854472	G-A	HET
SBS	Chr11	10484083	C-T	HET
SBS	Chr11	14364352	C-T	HET
SBS	Chr11	20947151	C-A	HET	LOC_Os11g35710
SBS	Chr11	26956924	G-A	HET
SBS	Chr12	3614164	G-T	HET
SBS	Chr12	5222128	C-T	HET
SBS	Chr12	11952112	G-A	HET
SBS	Chr12	22149602	G-T	HET	LOC_Os12g36130
SBS	Chr12	25553484	G-A	HET

Deletions: 28

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr10	1334576	1334576	1
Deletion	Chr9	2271095	2271103	9
Deletion	Chr3	2418017	2418017	1	LOC_Os03g04990
Deletion	Chr2	5323376	5323376	1
Deletion	Chr12	8885641	8885641	1
Deletion	Chr12	12264425	12264431	7
Deletion	Chr3	12928629	12928629	1
Deletion	Chr5	12972035	12972037	3
Deletion	Chr2	13779568	13779568	1
Deletion	Chr11	15924884	15924887	4
Deletion	Chr7	16588899	16588899	1
Deletion	Chr10	16694463	16694463	1	LOC_Os10g31830
Deletion	Chr12	17297001	17321000	24000	4
Deletion	Chr12	17325001	17339000	14000
Deletion	Chr9	17498429	17498437	9
Deletion	Chr8	17548124	17548124	1
Deletion	Chr12	17929202	17929219	18
Deletion	Chr2	20358380	20358381	2
Deletion	Chr5	23029001	23096000	67000	11
Deletion	Chr3	23260999	23260999	1
Deletion	Chr7	23530001	23539000	9000	LOC_Os07g39300
Deletion	Chr1	24082984	24082992	9
Deletion	Chr7	24297581	24297581	1
Deletion	Chr4	24318939	24318939	1	LOC_Os04g40970
Deletion	Chr3	27595635	27595636	2
Deletion	Chr11	27742143	27742223	81
Deletion	Chr11	28418108	28418180	73
Deletion	Chr3	30263544	30263554	11

Insertions: 14

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	2935474	2935510	37	LOC_Os01g06160
Insertion	Chr3	20245779	20245779	1
Insertion	Chr5	500547	500548	2
Insertion	Chr5	10664236	10664236	1
Insertion	Chr5	24169413	24169415	3
Insertion	Chr6	4265275	4265340	66
Insertion	Chr7	9954405	9954405	1
Insertion	Chr8	841351	841351	1
Insertion	Chr8	2723827	2723828	2
Insertion	Chr10	5707236	5707257	22	LOC_Os10g10380
Insertion	Chr11	16202909	16203003	95
Insertion	Chr11	18224070	18224070	1
Insertion	Chr2	7170181	7170181	1
Insertion	Chr3	5821633	5821633	1

Inversions: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr10	763873	1049516	LOC_Os10g02670
Inversion	Chr10	763914	1049519	LOC_Os10g02670
Inversion	Chr3	4413749	4941664	LOC_Os03g09920
Inversion	Chr3	4413756	4941668	LOC_Os03g09920
Inversion	Chr3	36320258	36320521	LOC_Os03g64290

Translocations: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr5	23086118	Chr3	14103761
Translocation	Chr5	23095749	Chr3	14103757

Main menu