Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 51

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Gene Affected
SBS	Chr1	6784988	G-A	HET
SBS	Chr1	10808594	T-A	HOMO
SBS	Chr1	12243746	A-T	HET
SBS	Chr1	16407873	G-A	HOMO	LOC_Os01g29270
SBS	Chr1	19393517	T-G	HOMO
SBS	Chr1	21390072	C-T	HET
SBS	Chr1	22409096	A-T	HET	LOC_Os01g39740
SBS	Chr1	23332079	G-A	HOMO
SBS	Chr1	26253533	A-G	HET
SBS	Chr1	36542466	A-G	HET
SBS	Chr2	1494185	T-A	HET
SBS	Chr2	5990075	C-A	HET
SBS	Chr2	11655382	T-G	HET
SBS	Chr2	12937003	A-G	HET
SBS	Chr2	29779845	G-A	HET
SBS	Chr3	3665869	G-A	HET
SBS	Chr3	4078610	G-A	HET
SBS	Chr3	5030517	C-T	HET
SBS	Chr3	21499012	C-A	HOMO
SBS	Chr3	28283074	C-A	HET	LOC_Os03g49660
SBS	Chr4	9955870	C-A	HET
SBS	Chr4	33150093	A-G	HET
SBS	Chr5	11954461	C-G	HET
SBS	Chr6	195573	A-G	HET
SBS	Chr6	3153226	G-T	HOMO
SBS	Chr6	3973355	A-T	HET
SBS	Chr6	5812183	G-A	HET
SBS	Chr6	12875344	C-G	HOMO
SBS	Chr6	16086741	T-A	HOMO
SBS	Chr6	21261989	A-G	HET	LOC_Os06g36280
SBS	Chr6	27105984	C-T	HET
SBS	Chr6	29671899	C-A	HET
SBS	Chr7	19511291	T-C	HET
SBS	Chr7	25996217	A-T	HET
SBS	Chr8	5849510	T-C	HET
SBS	Chr8	7324173	A-G	HET
SBS	Chr8	9552320	G-T	HET	LOC_Os08g15750
SBS	Chr8	23736132	A-T	HET
SBS	Chr9	2249385	C-A	HOMO
SBS	Chr9	2288993	T-C	HOMO
SBS	Chr9	13270635	C-A	HET
SBS	Chr9	20917538	A-T	HET
SBS	Chr9	22143481	T-C	HET
SBS	Chr10	19849357	A-G	HOMO
SBS	Chr10	20347849	G-C	HET
SBS	Chr11	8054255	C-T	HET
SBS	Chr11	9707658	G-A	HET
SBS	Chr11	13321735	A-G	HET
SBS	Chr11	15875568	A-G	HET
SBS	Chr11	17406203	C-G	HET	LOC_Os11g29950
SBS	Chr11	17427749	A-C	HET

Deletions: 24

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr11	477900	477903	4	LOC_Os11g01875
Deletion	Chr3	915058	915058	1
Deletion	Chr6	3185133	3185145	13
Deletion	Chr1	3770222	3770222	1	LOC_Os01g07840
Deletion	Chr8	5912857	5912866	10
Deletion	Chr9	6073289	6073296	8
Deletion	Chr11	7305780	7305839	60
Deletion	Chr7	8338866	8338881	16
Deletion	Chr2	9186880	9186886	7
Deletion	Chr4	10584741	10584746	6
Deletion	Chr4	10765951	10765961	11
Deletion	Chr8	12798538	12798544	7
Deletion	Chr11	13905682	13905684	3
Deletion	Chr3	14311635	14311636	2
Deletion	Chr7	15591897	15591897	1
Deletion	Chr10	18685461	18685462	2
Deletion	Chr11	18992213	18992213	1
Deletion	Chr10	19817430	19817443	14	LOC_Os10g36990
Deletion	Chr1	21992035	21992036	2	2
Deletion	Chr7	22207889	22207889	1
Deletion	Chr9	22238083	22238083	1
Deletion	Chr7	24817571	24817573	3
Deletion	Chr3	27274198	27274198	1	2
Deletion	Chr1	37372148	37372148	1

Insertions: 16

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	15602261	15602261	1	LOC_Os01g27910
Insertion	Chr2	10074733	10074736	4
Insertion	Chr4	33523026	33523071	46
Insertion	Chr9	874090	874148	59
Insertion	Chr9	2960970	2960971	2
Insertion	Chr10	22969312	22969313	2
Insertion	Chr12	6262406	6262408	3	LOC_Os12g11560
Insertion	Chr12	9721026	9721026	1
Insertion	Chr12	24906263	24906263	1
Insertion	Chr1	18308023	18308023	1
Insertion	Chr2	34709248	34709248	1
Insertion	Chr4	15990765	15990766	2
Insertion	Chr4	22550175	22550177	3
Insertion	Chr4	29747345	29747345	1	LOC_Os04g49890
Insertion	Chr5	16425954	16425960	7
Insertion	Chr9	16476759	16476760	2

Inversions: 8

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr12	11027255	11027703	LOC_Os12g19000
Inversion	Chr12	11027256	11027702	LOC_Os12g19000
Inversion	Chr2	14179385	14755250
Inversion	Chr2	14755267	15549668
Inversion	Chr2	15549642	15625374
Inversion	Chr5	22194158	22194358
Inversion	Chr1	36425803	37191012
Inversion	Chr1	36425804	36539298

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr12	12823541	Chr1	37191021
Translocation	Chr12	12824380	Chr1	21196632	LOC_Os01g37870
Translocation	Chr2	12931069	Chr1	36542274
Translocation	Chr2	12931076	Chr1	36544862	LOC_Os01g63060

Main menu