Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 51

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Gene Affected
SBS	Chr1	5252079	A-T	HET
SBS	Chr1	5988907	G-A	HET
SBS	Chr1	20054449	T-C	HET
SBS	Chr2	20704673	C-T	HOMO	LOC_Os02g34540
SBS	Chr2	21466177	T-C	HET
SBS	Chr2	22895313	G-T	HET	LOC_Os02g37880
SBS	Chr2	27517627	G-C	HOMO
SBS	Chr3	10579805	G-T	HET
SBS	Chr3	14005514	T-C	HOMO
SBS	Chr3	17326919	C-T	HET	LOC_Os03g30390
SBS	Chr4	1790777	T-C	HET
SBS	Chr4	11651254	A-G	HET
SBS	Chr4	21680455	A-T	HOMO
SBS	Chr4	21699147	G-A	HOMO
SBS	Chr4	22492524	C-T	HET
SBS	Chr4	31108201	G-T	HET
SBS	Chr4	34362001	C-A	HET
SBS	Chr5	7293648	C-T	HET
SBS	Chr5	8659486	C-T	HET
SBS	Chr5	9364834	G-C	HET	LOC_Os05g16500
SBS	Chr5	10456307	C-G	HET
SBS	Chr5	15864426	T-C	HET
SBS	Chr6	16458850	G-T	HET
SBS	Chr7	759819	G-A	HET
SBS	Chr7	5015022	A-G	HET
SBS	Chr7	6087145	C-A	HET
SBS	Chr7	10502053	T-C	HET
SBS	Chr7	11631477	G-A	HET
SBS	Chr7	22595564	T-A	HOMO
SBS	Chr8	968036	A-C	HET
SBS	Chr8	3789733	A-T	HET
SBS	Chr8	6481005	G-T	HOMO
SBS	Chr8	15373636	G-A	HET
SBS	Chr8	17670872	G-A	HET
SBS	Chr9	14076131	G-A	HET
SBS	Chr9	14106240	T-C	HET
SBS	Chr9	15480838	C-G	HET
SBS	Chr9	15671165	T-A	HET
SBS	Chr10	6260454	T-A	HET
SBS	Chr10	21943753	C-T	HOMO
SBS	Chr11	5461065	C-T	HET
SBS	Chr11	7374359	C-A	HET	LOC_Os11g13459
SBS	Chr11	14714579	G-A	HET
SBS	Chr11	16345567	G-A	HET	LOC_Os11g28400
SBS	Chr11	20783228	T-A	HOMO
SBS	Chr11	21574012	A-G	HET
SBS	Chr11	25258616	C-T	HOMO
SBS	Chr11	27083079	G-A	HOMO	LOC_Os11g44750
SBS	Chr11	27083080	A-T	HOMO	LOC_Os11g44750
SBS	Chr12	173462	C-T	HET
SBS	Chr12	583316	T-G	HET

Deletions: 32

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr12	578016	578017	2	2
Deletion	Chr1	991407	991408	2
Deletion	Chr4	1788947	1788947	1
Deletion	Chr12	2783964	2783965	2
Deletion	Chr1	2855673	2855678	6
Deletion	Chr4	3332047	3332047	1
Deletion	Chr3	3975150	3975156	7	LOC_Os03g07810
Deletion	Chr1	5822808	5822821	14
Deletion	Chr3	6281714	6281718	5
Deletion	Chr10	6482001	6583000	101000	11
Deletion	Chr10	6538743	6538743	1
Deletion	Chr10	6754001	6764000	10000	3
Deletion	Chr10	6936001	6963000	27000	3
Deletion	Chr5	7333468	7333468	1	LOC_Os05g12780
Deletion	Chr12	7863746	7863748	3
Deletion	Chr4	9181446	9181446	1
Deletion	Chr6	10275616	10275616	1
Deletion	Chr8	12075898	12075899	2
Deletion	Chr6	13050403	13050408	6
Deletion	Chr2	14209747	14209792	46
Deletion	Chr2	16765142	16765205	64
Deletion	Chr3	19164361	19164361	1
Deletion	Chr12	20170001	20215000	45000	9
Deletion	Chr12	20219001	20241000	22000	5
Deletion	Chr12	20270001	20292000	22000	5
Deletion	Chr12	20295001	20314000	19000	5
Deletion	Chr12	20327001	20428000	101000	19
Deletion	Chr12	20440542	20440543	2
Deletion	Chr10	21671546	21671546	1
Deletion	Chr6	25334415	25334415	1
Deletion	Chr3	26132675	26132678	4	LOC_Os03g46220
Deletion	Chr1	26213072	26213144	73

Insertions: 20

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	614200	614201	2
Insertion	Chr1	4840765	4840765	1	LOC_Os01g09490
Insertion	Chr1	21322202	21322202	1
Insertion	Chr2	12208354	12208354	1
Insertion	Chr3	1302316	1302326	11
Insertion	Chr3	13822301	13822301	1
Insertion	Chr3	19577286	19577286	1
Insertion	Chr4	31847295	31847295	1
Insertion	Chr5	10007553	10007554	2
Insertion	Chr6	26111618	26111618	1	LOC_Os06g43450
Insertion	Chr8	16849404	16849431	28
Insertion	Chr10	317850	317850	1	LOC_Os10g01490
Insertion	Chr10	3923863	3923863	1
Insertion	Chr11	20598535	20598535	1
Insertion	Chr12	1898817	1898898	82
Insertion	Chr12	13522740	13522746	7
Insertion	Chr1	17348875	17348876	2
Insertion	Chr2	30810267	30810268	2
Insertion	Chr4	24008229	24008229	1
Insertion	Chr5	7569029	7569029	1

Inversions: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr3	11277052	11277205
Inversion	Chr8	17219740	17588421	LOC_Os08g28214
Inversion	Chr12	21912122	21963290
Inversion	Chr12	21921001	21963298

No Translocation

Main menu