Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 27

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Gene Affected
SBS	Chr1	22613875	C-T	HOMO
SBS	Chr1	22613876	G-T	HOMO
SBS	Chr1	34269782	G-T	HET
SBS	Chr2	7559589	A-G	HET	LOC_Os02g13910
SBS	Chr3	5606058	C-A	HET
SBS	Chr3	6928322	T-A	HET
SBS	Chr3	9150551	G-A	HET
SBS	Chr3	9347913	C-T	HET
SBS	Chr3	20597681	G-A	HET
SBS	Chr3	26544188	G-A	HOMO
SBS	Chr3	27636065	A-C	HET
SBS	Chr5	19875195	A-T	HET
SBS	Chr6	8106322	C-A	HET
SBS	Chr7	12773603	C-T	HET	LOC_Os07g22670
SBS	Chr7	27551053	G-T	HET
SBS	Chr8	17339157	A-G	HET
SBS	Chr8	18060819	T-C	HET
SBS	Chr9	704502	G-A	HET
SBS	Chr9	15955902	A-G	HET
SBS	Chr9	18712480	T-C	HET
SBS	Chr10	1264364	A-C	HET
SBS	Chr10	9015868	G-A	HET
SBS	Chr10	10591719	G-A	HET
SBS	Chr10	14721520	C-T	HET
SBS	Chr10	21822743	C-T	HET
SBS	Chr11	21351171	T-C	HET
SBS	Chr12	16285740	G-A	HET

Deletions: 8

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	5526915	5526915	1
Deletion	Chr1	8727093	8727102	10
Deletion	Chr7	11121788	11121876	89	LOC_Os07g18790
Deletion	Chr8	16022228	16022263	36
Deletion	Chr6	18703667	18703672	6
Deletion	Chr9	19591256	19591270	15	LOC_Os09g32860
Deletion	Chr12	23748738	23748747	10
Deletion	Chr3	27916701	27916701	1

Insertions: 13

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr2	7041260	7041260	1	LOC_Os02g13210
Insertion	Chr2	21801860	21801873	14
Insertion	Chr3	22654679	22654679	1
Insertion	Chr3	31280028	31280037	10
Insertion	Chr4	856307	856430	124
Insertion	Chr5	9087370	9087426	57
Insertion	Chr5	9944107	9944107	1
Insertion	Chr7	22157247	22157257	11
Insertion	Chr8	694847	694906	60
Insertion	Chr9	15113852	15113853	2
Insertion	Chr11	19264412	19264413	2
Insertion	Chr12	12656551	12656551	1
Insertion	Chr6	12594529	12594529	1

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr7	6573705	6573966
Inversion	Chr9	12543835	12544057

No Translocation

Main menu