Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 46

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Gene Affected
SBS	Chr1	12957086	G-A	HET	LOC_Os01g23020
SBS	Chr1	29006317	G-A	HET
SBS	Chr1	39148752	A-G	HET
SBS	Chr2	4065613	G-A	HET
SBS	Chr2	18611166	T-A	HET
SBS	Chr2	19850161	C-T	HOMO
SBS	Chr2	20044152	C-A	HET
SBS	Chr2	27796058	C-T	HET
SBS	Chr3	7222240	T-C	HET
SBS	Chr3	8696812	T-C	HOMO
SBS	Chr3	11253922	T-C	HET	LOC_Os03g19980
SBS	Chr3	16396705	G-A	HET
SBS	Chr3	33906328	C-T	HET
SBS	Chr3	33906329	C-T	HET	LOC_Os03g59570
SBS	Chr4	10551655	G-A	HET
SBS	Chr4	12816038	C-T	HET
SBS	Chr4	14818682	G-T	HET
SBS	Chr4	15946484	G-T	HET
SBS	Chr4	21567313	C-T	HET
SBS	Chr4	23820288	G-A	HET
SBS	Chr4	27295471	C-T	HET
SBS	Chr5	4726835	C-A	HET
SBS	Chr5	6133422	G-T	HET
SBS	Chr5	6996566	C-A	HET
SBS	Chr5	8803584	G-A	HET	LOC_Os05g15550
SBS	Chr5	21044273	G-T	HET
SBS	Chr5	28332978	C-T	HET
SBS	Chr6	2806609	C-A	HET
SBS	Chr6	6476721	G-A	HET
SBS	Chr6	13234703	C-G	HOMO
SBS	Chr6	28782185	A-G	HET
SBS	Chr7	668009	A-G	HET
SBS	Chr7	13903552	C-T	HET
SBS	Chr8	4979145	T-C	HET	LOC_Os08g08600
SBS	Chr8	21147612	C-A	HET
SBS	Chr9	7135251	G-A	HET
SBS	Chr9	12099446	C-A	HET
SBS	Chr9	16593804	A-T	HET
SBS	Chr10	8811798	A-C	HET
SBS	Chr11	1922086	G-A	HET
SBS	Chr11	23319374	C-T	HET
SBS	Chr11	25647959	G-A	HET
SBS	Chr12	4246542	A-C	HET
SBS	Chr12	14328407	C-G	HET	LOC_Os12g24960
SBS	Chr12	15529192	C-T	HET
SBS	Chr12	15613360	A-G	HOMO

Deletions: 33

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr6	10984	11035	52
Deletion	Chr9	132300	132300	1
Deletion	Chr6	1765668	1765669	2	LOC_Os06g04200
Deletion	Chr12	2204389	2204390	2
Deletion	Chr1	5392481	5392491	11
Deletion	Chr3	6477306	6477326	21
Deletion	Chr7	6597562	6597562	1
Deletion	Chr12	6946501	6946504	4
Deletion	Chr10	8811666	8811675	10
Deletion	Chr3	9141835	9141837	3
Deletion	Chr3	9449172	9449186	15
Deletion	Chr10	14354957	14354957	1
Deletion	Chr12	16443505	16443506	2
Deletion	Chr1	16828231	16828240	10
Deletion	Chr8	17061802	17061802	1	LOC_Os08g28010
Deletion	Chr11	17105893	17105893	1
Deletion	Chr8	17341850	17341859	10
Deletion	Chr5	17562409	17562438	30
Deletion	Chr3	17888707	17888708	2
Deletion	Chr8	17945791	17945791	1
Deletion	Chr10	18372950	18372951	2
Deletion	Chr1	19347082	19347085	4	LOC_Os01g34960
Deletion	Chr2	19849660	19849673	14
Deletion	Chr1	19990924	19990937	14
Deletion	Chr6	22253964	22253964	1
Deletion	Chr1	25524879	25524879	1
Deletion	Chr5	25967001	26012000	45000	11
Deletion	Chr2	27242682	27242683	2
Deletion	Chr8	27542888	27542888	1
Deletion	Chr5	27618495	27618495	1
Deletion	Chr3	28403047	28403047	1
Deletion	Chr1	30154203	30154214	12
Deletion	Chr6	30650597	30650599	3	LOC_Os06g50630

Insertions: 15

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	31773232	31773233	2
Insertion	Chr3	8825062	8825070	9
Insertion	Chr3	13042067	13042105	39
Insertion	Chr3	16394628	16394741	114
Insertion	Chr4	1166988	1166988	1
Insertion	Chr5	8116387	8116387	1	LOC_Os05g14400
Insertion	Chr5	11864073	11864073	1
Insertion	Chr5	25986019	25986020	2
Insertion	Chr6	9648787	9648808	22
Insertion	Chr7	9507579	9507579	1
Insertion	Chr7	14068283	14068283	1
Insertion	Chr8	14231324	14231324	1
Insertion	Chr10	2305704	2305791	88
Insertion	Chr3	22938455	22938456	2
Insertion	Chr12	8867326	8867326	1

Inversions: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2
Inversion	Chr9	5909295	5910610
Inversion	Chr9	5909303	5909576
Inversion	Chr6	5941028	6727759
Inversion	Chr6	5941326	6727769
Inversion	Chr2	32617874	32618028

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr7	5472061	Chr5	24137648	LOC_Os05g41220
Translocation	Chr11	8330121	Chr6	25427108
Translocation	Chr11	8330151	Chr6	25433132
Translocation	Chr11	10321343	Chr1	16146410

Main menu