Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 41

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	5490219	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	5754626	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	42253912	C-T	HOMO	INTRON
SBS	Chr2	3447289	T-C	HET	INTRON
SBS	Chr2	7254042	C-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr2	9855193	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	10594535	G-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	11059187	G-C	HET	INTRON
SBS	Chr2	12431282	A-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	6251141	A-C	HET	INTRON
SBS	Chr3	19142828	G-T	HET	INTRON
SBS	Chr3	19476472	T-C	HET	INTRON
SBS	Chr3	22778211	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	10566452	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr5	2054779	T-C	HOMO	INTRON
SBS	Chr5	2342873	G-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr5	13454900	A-G	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr5	24646633	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr5	26018106	G-A	HET	INTRON
SBS	Chr6	4200339	G-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr6	10535234	A-G	HOMO	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g18090
SBS	Chr7	5572464	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g10390
SBS	Chr7	13742987	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g24190
SBS	Chr7	22544797	C-T	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr8	2029430	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr8	16800433	T-A	HOMO	INTRON
SBS	Chr8	21519429	A-G	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr9	7128655	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr9	7921878	G-T	HET	INTRON
SBS	Chr10	1524654	C-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr10	4632556	C-G	HET	INTRON
SBS	Chr10	12223828	T-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr10	22486541	G-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr11	2703765	A-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	6090613	T-A	HET	INTRON
SBS	Chr11	9091008	T-A	HET	INTRON
SBS	Chr11	9126221	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	20613335	T-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	22451893	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g37880
SBS	Chr12	8718562	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	12509172	G-C	HET	INTERGENIC

Deletions: 18

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	548233	548235	2
Deletion	Chr10	1498250	1498267	17	LOC_Os10g03480
Deletion	Chr3	5033211	5033212	1
Deletion	Chr3	6275583	6275584	1	LOC_Os03g11960
Deletion	Chr11	8169058	8169059	1	LOC_Os11g14544
Deletion	Chr11	9327664	9327673	9
Deletion	Chr6	12009690	12009691	1	LOC_Os06g20810
Deletion	Chr7	12466480	12466487	7
Deletion	Chr11	14088077	14088094	17
Deletion	Chr11	14331572	14331573	1
Deletion	Chr10	17174691	17174720	29
Deletion	Chr5	18786033	18786034	1
Deletion	Chr6	20757009	20757034	25
Deletion	Chr1	23229123	23229179	56
Deletion	Chr5	23633554	23633564	10	LOC_Os05g40230
Deletion	Chr1	24438465	24438473	8
Deletion	Chr5	24522128	24522142	14
Deletion	Chr3	27295112	27295113	1

Insertions: 5

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr2	17866036	17866037	2
Insertion	Chr2	19293462	19293463	2
Insertion	Chr4	19644590	19644591	2
Insertion	Chr11	26056952	26056952	1
Insertion	Chr6	12858981	12858981	1

Inversions: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	16913433	16949626

Translocations: 7

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr10	1222908	Chr8	16258229
Translocation	Chr10	9894531	Chr1	23525393
Translocation	Chr11	11940984	Chr2	8231003
Translocation	Chr11	11940985	Chr2	8231004
Translocation	Chr11	13171547	Chr8	9661280	LOC_Os11g22910
Translocation	Chr12	21494634	Chr11	17510995	LOC_Os12g35360
Translocation	Chr12	24854292	Chr4	13170895

Main menu