Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 42

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Gene Affected
SBS	Chr1	4159911	G-A	HET
SBS	Chr1	5431653	A-T	HET
SBS	Chr1	20983118	C-T	HET
SBS	Chr1	26392556	G-A	HET
SBS	Chr2	11566312	T-C	HET
SBS	Chr2	25800181	T-C	HET
SBS	Chr2	33211779	A-T	HET
SBS	Chr3	2222476	C-T	HET
SBS	Chr3	11356028	T-C	HET
SBS	Chr3	14692045	T-G	HET
SBS	Chr3	20934464	G-A	HET	LOC_Os03g37750
SBS	Chr3	25041150	T-C	HET	LOC_Os03g44484
SBS	Chr3	25050935	C-A	HET
SBS	Chr4	5871573	C-A	HET
SBS	Chr4	7763837	C-A	HET
SBS	Chr4	26004966	T-C	HET
SBS	Chr4	28208670	C-T	HET	LOC_Os04g47560
SBS	Chr5	8366220	G-C	HOMO
SBS	Chr5	12403219	A-C	HOMO
SBS	Chr5	12763313	C-T	HET	LOC_Os05g22480
SBS	Chr5	14563263	A-G	HET
SBS	Chr6	10413544	G-A	HET
SBS	Chr6	10628170	C-T	HET
SBS	Chr6	11914063	G-T	HET
SBS	Chr6	26442498	A-G	HET
SBS	Chr7	29693053	C-T	HET
SBS	Chr8	19547159	G-C	HET
SBS	Chr8	28322993	A-G	HET
SBS	Chr9	5408034	T-A	HET
SBS	Chr9	8833712	C-A	HET
SBS	Chr9	19157255	C-T	HET
SBS	Chr10	3461311	C-T	HET
SBS	Chr10	4476355	T-A	HET
SBS	Chr10	13035187	C-A	HET
SBS	Chr11	5819077	C-T	HET
SBS	Chr11	7969526	G-A	HOMO
SBS	Chr11	10251313	C-A	HET
SBS	Chr11	17063576	C-A	HOMO
SBS	Chr11	23816458	G-A	HET
SBS	Chr11	24066529	G-T	HET
SBS	Chr12	6865604	G-A	HET
SBS	Chr12	10718573	G-A	HET

Deletions: 26

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr12	1762198	1762201	4
Deletion	Chr3	2936906	2936908	3
Deletion	Chr9	3290260	3290260	1	LOC_Os09g06870
Deletion	Chr11	3435471	3435471	1
Deletion	Chr7	3703560	3703560	1
Deletion	Chr11	5644141	5644151	11
Deletion	Chr2	7077097	7077098	2
Deletion	Chr5	7615570	7615570	1	LOC_Os05g13740
Deletion	Chr7	9295944	9295944	1
Deletion	Chr11	9317865	9317869	5	LOC_Os11g16790
Deletion	Chr5	9966146	9966147	2
Deletion	Chr8	14465216	14465216	1
Deletion	Chr5	15178037	15178060	24	LOC_Os05g26100
Deletion	Chr8	16383463	16383468	6
Deletion	Chr1	16782225	16782272	48
Deletion	Chr7	17459220	17459237	18
Deletion	Chr8	17973215	17973215	1	LOC_Os08g29290
Deletion	Chr11	17986227	17986237	11
Deletion	Chr12	18952523	18952528	6
Deletion	Chr8	19401126	19401133	8
Deletion	Chr12	21987873	21987873	1
Deletion	Chr2	22903732	22903732	1
Deletion	Chr9	22948535	22948538	4
Deletion	Chr7	24028455	24028455	1
Deletion	Chr6	25098121	25098121	1
Deletion	Chr1	27882656	27882656	1

Insertions: 24

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr2	6780966	6780968	3
Insertion	Chr2	25026739	25026739	1
Insertion	Chr3	8058559	8058559	1
Insertion	Chr3	19505123	19505123	1
Insertion	Chr4	8143986	8144006	21
Insertion	Chr4	13911779	13911779	1
Insertion	Chr4	30825484	30825568	85
Insertion	Chr6	953419	953420	2
Insertion	Chr7	8582263	8582263	1
Insertion	Chr7	18965826	18965827	2
Insertion	Chr7	21267142	21267142	1
Insertion	Chr10	5102960	5102960	1	LOC_Os10g09460
Insertion	Chr10	10527807	10527807	1
Insertion	Chr10	14211792	14211792	1
Insertion	Chr10	19776481	19776481	1	2
Insertion	Chr10	20706353	20706364	12
Insertion	Chr11	24795270	24795340	71
Insertion	Chr12	5275877	5275877	1
Insertion	Chr12	14357565	14357683	119
Insertion	Chr3	27685680	27685680	1
Insertion	Chr4	1824815	1824818	4
Insertion	Chr11	18909144	18909144	1
Insertion	Chr11	23532553	23532553	1
Insertion	Chr12	20981179	20981179	1

No Inversion

Translocations: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr6	21576307	Chr1	15444225	LOC_Os06g36690

Main menu