Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 49

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Gene Affected
SBS	Chr1	3886657	A-G	HET
SBS	Chr1	38332674	G-T	HET
SBS	Chr1	39745734	T-A	HET
SBS	Chr2	4025848	C-A	HET
SBS	Chr2	4914662	G-A	HET
SBS	Chr2	7155170	T-C	HET
SBS	Chr2	22129241	A-G	HET
SBS	Chr2	23450058	C-T	HET	LOC_Os02g38795
SBS	Chr3	2299185	A-G	HET	LOC_Os03g04830
SBS	Chr3	13529913	G-A	HET	LOC_Os03g23840
SBS	Chr3	31164788	T-C	HET
SBS	Chr4	4447682	A-C	HET
SBS	Chr4	9542955	T-C	HET	LOC_Os04g17440
SBS	Chr4	10213744	C-T	HET	LOC_Os04g18480
SBS	Chr4	16987472	G-T	HET
SBS	Chr5	6899344	G-A	HET
SBS	Chr5	7443828	G-A	HET
SBS	Chr5	21133382	G-T	HET
SBS	Chr5	23540858	C-T	HET
SBS	Chr6	6662458	G-T	HOMO
SBS	Chr6	28492224	T-G	HOMO
SBS	Chr7	1425455	G-A	HET
SBS	Chr7	12598268	C-T	HET	LOC_Os07g22420
SBS	Chr7	14201171	G-A	HET
SBS	Chr7	15027931	C-T	HET
SBS	Chr7	19815720	A-C	HET	LOC_Os07g33190
SBS	Chr8	8057982	T-C	HET	LOC_Os08g13560
SBS	Chr8	10106581	C-A	HET
SBS	Chr8	20419738	C-T	HET
SBS	Chr8	22998746	C-T	HET
SBS	Chr9	1006095	T-A	HET
SBS	Chr9	1968195	C-T	HET
SBS	Chr9	5531772	G-T	HET	LOC_Os09g10170
SBS	Chr9	6384058	G-A	HET
SBS	Chr9	7940618	C-T	HET
SBS	Chr10	280261	A-T	HET
SBS	Chr10	3246129	C-T	HOMO
SBS	Chr10	7468754	A-G	HOMO	LOC_Os10g13740
SBS	Chr10	9000071	T-C	HET
SBS	Chr10	11504281	G-T	HOMO
SBS	Chr11	7709977	T-G	HET
SBS	Chr11	9364181	A-G	HET	LOC_Os11g16870
SBS	Chr11	11269134	A-T	HET
SBS	Chr11	11858086	G-A	HET
SBS	Chr11	14900362	A-G	HET
SBS	Chr11	22347678	C-A	HET
SBS	Chr11	23704259	G-C	HOMO
SBS	Chr12	2549144	C-T	HET
SBS	Chr12	8161148	C-T	HOMO

Deletions: 30

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr6	61640	61641	2
Deletion	Chr8	2803239	2803239	1
Deletion	Chr7	3162617	3162714	98
Deletion	Chr5	5667098	5667130	33
Deletion	Chr9	5933109	5933109	1
Deletion	Chr2	6209001	6242000	33000	5
Deletion	Chr2	6333331	6333331	1
Deletion	Chr3	8978766	8978774	9
Deletion	Chr9	10471205	10471217	13
Deletion	Chr7	10535591	10535591	1
Deletion	Chr4	10644871	10644871	1
Deletion	Chr11	10703569	10703571	3
Deletion	Chr9	11046897	11046897	1
Deletion	Chr7	12156682	12157014	333
Deletion	Chr7	12156938	12156938	1
Deletion	Chr11	12157207	12157209	3
Deletion	Chr6	14367156	14367158	3
Deletion	Chr11	14700174	14700174	1	2
Deletion	Chr7	14844217	14844217	1
Deletion	Chr12	15067671	15067671	1
Deletion	Chr2	15721186	15721186	1
Deletion	Chr12	18620910	18620963	54
Deletion	Chr3	19675704	19675706	3
Deletion	Chr3	20000359	20000359	1	LOC_Os03g36050
Deletion	Chr10	22956361	22956368	8
Deletion	Chr4	24860038	24860038	1
Deletion	Chr12	25546322	25546322	1
Deletion	Chr5	26231728	26231729	2
Deletion	Chr11	27415668	27415750	83
Deletion	Chr3	35328950	35329041	92

Insertions: 18

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr1	1527239	1527239	1
Insertion	Chr1	33400039	33400149	111
Insertion	Chr1	41423418	41423418	1
Insertion	Chr2	1890462	1890462	1
Insertion	Chr2	26913002	26913090	89
Insertion	Chr4	2675232	2675233	2
Insertion	Chr4	12529159	12529168	10
Insertion	Chr4	29551565	29551603	39
Insertion	Chr5	11066189	11066189	1
Insertion	Chr6	302007	302007	1
Insertion	Chr6	19135662	19135771	110
Insertion	Chr7	2373481	2373481	1
Insertion	Chr8	11334305	11334341	37
Insertion	Chr9	111531	111532	2
Insertion	Chr9	21444889	21444889	1
Insertion	Chr11	13690738	13690738	1
Insertion	Chr2	17538656	17538656	1
Insertion	Chr10	20252917	20252917	1

No Inversion

Translocations: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr7	6826558	Chr4	30894570

Main menu