Search Results

Mutant Information

Mutant Name	FN4851-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4851-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]
Mapping (Hover to Zoom-In)

Variant Information

Single base substitutions: 60

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Gene Affected
SBS	Chr1	9109413	G-A	HET
SBS	Chr1	9657991	T-A	HET
SBS	Chr1	12697517	A-G	HET
SBS	Chr1	12998942	C-T	HET
SBS	Chr1	13041860	T-G	HET
SBS	Chr1	18434301	T-A	HET
SBS	Chr1	30184684	C-T	HET
SBS	Chr1	34766959	A-T	HET
SBS	Chr1	35110668	T-A	HET
SBS	Chr2	10821024	G-A	HOMO
SBS	Chr2	14623523	T-C	HOMO
SBS	Chr2	17373486	C-T	HET
SBS	Chr2	25252242	C-G	HET
SBS	Chr2	26430326	C-A	HET	LOC_Os02g43800
SBS	Chr2	27808726	G-T	HET
SBS	Chr3	7396803	C-T	HET	LOC_Os03g13670
SBS	Chr3	7396804	C-T	HET
SBS	Chr3	14886260	C-T	HET
SBS	Chr3	24068935	A-G	HET
SBS	Chr3	24291378	C-T	HET
SBS	Chr3	27844908	T-C	HET
SBS	Chr4	24968592	A-G	HET
SBS	Chr4	27670615	T-C	HET
SBS	Chr4	31372681	A-G	HET
SBS	Chr4	32621193	A-G	HET
SBS	Chr5	164174	A-G	HET
SBS	Chr5	1099193	G-T	HET	LOC_Os05g02960
SBS	Chr5	9796774	T-G	HOMO
SBS	Chr5	25388759	T-A	HET
SBS	Chr5	28048657	G-T	HET
SBS	Chr6	2128535	C-T	HOMO
SBS	Chr6	22822204	G-A	HET	LOC_Os06g38510
SBS	Chr6	23923345	C-G	HET	LOC_Os06g40180
SBS	Chr6	27416889	T-C	HET
SBS	Chr7	2221231	G-A	HET
SBS	Chr7	2656164	A-T	HET
SBS	Chr7	2905429	C-T	HET
SBS	Chr7	6804611	A-T	HET
SBS	Chr7	7613037	T-C	HET
SBS	Chr7	13349020	T-A	HET
SBS	Chr7	15531075	A-C	HET
SBS	Chr7	16414214	G-A	HET
SBS	Chr7	22282903	G-A	HOMO
SBS	Chr7	23407269	A-T	HET
SBS	Chr8	16764632	C-T	HET
SBS	Chr9	9809515	T-A	HET
SBS	Chr9	11095712	G-C	HET	LOC_Os09g18100
SBS	Chr9	11662159	G-T	HET
SBS	Chr9	17051118	A-T	HET
SBS	Chr10	9473808	G-A	HET
SBS	Chr11	302432	G-A	HET
SBS	Chr11	1051319	C-T	HET
SBS	Chr11	6109421	C-T	HET
SBS	Chr11	16166020	G-A	HET
SBS	Chr11	17105320	C-T	HET
SBS	Chr12	5518996	G-A	HET
SBS	Chr12	10907843	A-T	HET
SBS	Chr12	12607671	A-G	HET	LOC_Os12g22320
SBS	Chr12	16419871	A-T	HET
SBS	Chr12	25108110	C-T	HET

Deletions: 50

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr10	69365	69365	1
Deletion	Chr4	477291	477291	1	LOC_Os04g01720
Deletion	Chr5	731829	731830	2	LOC_Os05g02280
Deletion	Chr1	871584	871584	1
Deletion	Chr6	999746	999749	4	LOC_Os06g02750
Deletion	Chr3	1987713	1987748	36
Deletion	Chr11	2033551	2033551	1
Deletion	Chr12	4920661	4920664	4
Deletion	Chr2	5168789	5168789	1
Deletion	Chr1	5466797	5466799	3	LOC_Os01g10380
Deletion	Chr10	5682407	5682416	10
Deletion	Chr10	6835640	6835640	1
Deletion	Chr9	7861671	7861688	18
Deletion	Chr7	8449006	8449006	1	LOC_Os07g14800
Deletion	Chr9	8914955	8914955	1
Deletion	Chr12	9228076	9228079	4
Deletion	Chr5	9928918	9928918	1
Deletion	Chr6	10428913	10429012	100
Deletion	Chr12	11689744	11689744	1
Deletion	Chr1	12029910	12030015	106
Deletion	Chr1	12180234	12180234	1
Deletion	Chr7	12181358	12181358	1
Deletion	Chr6	12383777	12383777	1
Deletion	Chr1	13181308	13181324	17
Deletion	Chr8	13462575	13462575	1	LOC_Os08g22340
Deletion	Chr6	14136593	14136595	3
Deletion	Chr11	14953509	14953519	11
Deletion	Chr1	15530854	15530865	12
Deletion	Chr11	16183465	16183465	1
Deletion	Chr9	16413949	16413969	21
Deletion	Chr11	16621114	16621114	1
Deletion	Chr1	16853131	16853283	153
Deletion	Chr1	16907493	16907494	2	LOC_Os01g30956
Deletion	Chr2	17885441	17885498	58
Deletion	Chr5	18371837	18371837	1
Deletion	Chr7	19107027	19107029	3
Deletion	Chr11	19286289	19286290	2
Deletion	Chr10	19448500	19448508	9
Deletion	Chr6	19679633	19679633	1	LOC_Os06g33820
Deletion	Chr2	20195535	20195535	1
Deletion	Chr7	20844717	20844719	3	LOC_Os07g34780
Deletion	Chr9	22712430	22712430	1
Deletion	Chr2	23971362	23971438	77	LOC_Os02g39680
Deletion	Chr7	24388627	24388640	14
Deletion	Chr12	25398084	25398115	32
Deletion	Chr2	27649584	27649584	1
Deletion	Chr4	28986080	28986082	3	LOC_Os04g48640
Deletion	Chr1	29699617	29699617	1
Deletion	Chr2	32125633	32125644	12
Deletion	Chr1	37267646	37267648	3	LOC_Os01g64160

Insertions: 24

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	19715308	19715308	1
Insertion	Chr2	9244223	9244230	8
Insertion	Chr4	23681804	23681804	1
Insertion	Chr5	2697098	2697099	2
Insertion	Chr6	8017210	8017210	1
Insertion	Chr6	18870148	18870148	1	LOC_Os06g32450
Insertion	Chr6	29315419	29315419	1
Insertion	Chr7	1406972	1406972	1	LOC_Os07g03520
Insertion	Chr7	12212370	12212373	4
Insertion	Chr7	27764597	27764676	80
Insertion	Chr7	28611209	28611209	1
Insertion	Chr8	6964799	6964799	1
Insertion	Chr8	12707918	12707918	1
Insertion	Chr8	16785276	16785387	112
Insertion	Chr9	6695975	6695988	14
Insertion	Chr10	7911535	7911535	1
Insertion	Chr10	10201493	10201494	2
Insertion	Chr11	11943459	11943459	1
Insertion	Chr11	12095004	12095056	53
Insertion	Chr12	2146851	2146851	1
Insertion	Chr12	17144623	17144679	57
Insertion	Chr12	24603359	24603359	1
Insertion	Chr1	26353727	26353728	2
Insertion	Chr12	26180459	26180459	1

Inversions: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr11	8296636	9131271

Translocations: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr6	27132994	Chr1	12716497

Main menu

You are here

Search Results