Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 41

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	11193847	G-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr1	13593840	A-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr1	33030860	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	34011074	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	17170	A-T	HET	INTRON
SBS	Chr2	4869234	C-A	HET	UTR_3_PRIME
SBS	Chr2	8429575	A-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	8429576	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	4679911	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	4679912	G-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	5869425	T-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	15716077	C-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	17951361	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	18082797	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g31670
SBS	Chr3	21474006	A-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	8257362	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	12702951	T-C	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr4	30756664	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	34704331	G-A	HOMO	INTRON
SBS	Chr5	18549255	G-A	HOMO	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr5	23995745	T-C	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr6	29889862	T-C	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr7	3771543	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	6168171	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g11190
SBS	Chr7	8226557	G-C	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr7	8404042	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	22649649	T-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g37760
SBS	Chr7	24100446	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	24100447	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr8	21567871	A-T	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr8	23291986	C-A	HET	INTRON
SBS	Chr8	26385781	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr9	22708175	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g39560
SBS	Chr10	20103763	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	3578685	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	6372712	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	15495895	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	11329563	C-T	HET	INTRON
SBS	Chr12	11329564	C-T	HET	INTRON
SBS	Chr12	12736779	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	18830023	C-A	HET	INTERGENIC

Deletions: 15

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr1	1899045	1962912	63867	14
Deletion	Chr12	4240187	4240196	9
Deletion	Chr1	5733716	6133908	400192	62
Deletion	Chr9	8276001	8298000	22000	LOC_Os09g14019
Deletion	Chr9	8300001	8837000	537000	79
Deletion	Chr9	8849001	9238000	389000	36
Deletion	Chr1	9349105	9349120	15
Deletion	Chr4	13227567	13227572	5
Deletion	Chr11	13770646	13770662	16	LOC_Os11g24180
Deletion	Chr10	14720493	14720495	2
Deletion	Chr3	16744217	16804867	60650	8
Deletion	Chr8	19421445	19421461	16
Deletion	Chr12	22024107	22024108	1
Deletion	Chr5	22435384	22435397	13
Deletion	Chr8	26831675	26831677	2

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr3	15729995	15729995	1
Insertion	Chr8	24213433	24213436	4
Insertion	Chr1	27677098	27677098	1

Inversions: 10

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	5603085	6133900
Inversion	Chr1	5603124	6179412
Inversion	Chr1	5679768	5734560
Inversion	Chr3	16118607	17898655
Inversion	Chr3	16152012	16747804	LOC_Os03g28090
Inversion	Chr3	16153946	17898658
Inversion	Chr8	20874206	21093656	LOC_Os08g33460
Inversion	Chr8	21331974	21463728
Inversion	Chr1	32476652	32735060	LOC_Os01g56360
Inversion	Chr1	32476826	32735061	LOC_Os01g56360

Translocations: 6

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr5	13274177	Chr3	16153925	LOC_Os05g23250
Translocation	Chr5	13274178	Chr1	5733725	2
Translocation	Chr5	13274213	Chr3	16152032	2
Translocation	Chr3	16153924	Chr1	5734024	LOC_Os01g10710
Translocation	Chr9	16399418	Chr1	5734550	LOC_Os09g26970
Translocation	Chr9	16399421	Chr1	5734040	2

Main menu