Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 40

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	1647607	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	16480980	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g29409
SBS	Chr1	27949322	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	27949323	T-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	30096978	T-A	HET	INTRON
SBS	Chr2	546814	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g01980
SBS	Chr2	10199560	T-A	HET	INTRON
SBS	Chr2	11385050	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	19180485	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g32440
SBS	Chr3	1838424	C-A	HOMO	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g04030
SBS	Chr3	11460747	C-T	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr4	1605980	G-A	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr4	13566262	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	15325223	C-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os04g26290
SBS	Chr4	19045630	C-T	HOMO	INTRON
SBS	Chr4	29148628	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr5	17544124	G-A	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr5	18217872	T-C	HOMO	INTRON
SBS	Chr5	20369899	T-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr5	21364146	G-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr5	29918193	G-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr6	20211010	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr6	25778143	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	2840710	C-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	9548849	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	10432056	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g17670
SBS	Chr7	18504864	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g31260
SBS	Chr7	18745419	G-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr7	24175634	A-G	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr8	4669943	G-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr8	23781008	G-A	HOMO	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr9	4973997	C-T	HOMO	UTR_5_PRIME
SBS	Chr9	16564177	A-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	9209696	G-C	HET	INTRON
SBS	Chr11	10982717	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	14480752	G-A	HET	INTRON
SBS	Chr11	18841562	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	22605031	C-T	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr12	4839220	A-G	HET	INTRON
SBS	Chr12	16345352	G-A	HET	INTERGENIC

Deletions: 18

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr9	5084012	5084013	1
Deletion	Chr8	5400558	5400560	2
Deletion	Chr3	7598931	7598932	1
Deletion	Chr2	9432896	9432897	1
Deletion	Chr2	10538517	10538518	1	LOC_Os02g18140
Deletion	Chr6	14606073	14606090	17
Deletion	Chr12	14935751	14935752	1
Deletion	Chr4	15295274	15295290	16
Deletion	Chr7	16113702	16113711	9
Deletion	Chr11	17814570	17814574	4
Deletion	Chr1	20953205	20953213	8
Deletion	Chr12	23118338	23118339	1
Deletion	Chr1	24697497	24697512	15
Deletion	Chr11	25399880	25399891	11
Deletion	Chr12	25630446	25630504	58
Deletion	Chr6	27763164	27763217	53
Deletion	Chr5	27941667	27941672	5
Deletion	Chr3	31086448	31086460	12	LOC_Os03g54220

Insertions: 4

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr11	25810310	25810321	12	LOC_Os11g42850
Insertion	Chr12	27012459	27012461	3
Insertion	Chr5	24126885	24126885	1
Insertion	Chr6	981596	981596	1

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr8	1790576	2572122
Inversion	Chr11	8411734	9428377	LOC_Os11g17014

No Translocation

Main menu