Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 39

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	1784288	A-C	HET
SBS	Chr1	5903487	G-A	HET
SBS	Chr1	12150396	G-A	HET
SBS	Chr1	13504064	G-A	HET
SBS	Chr1	15359468	A-T	HET
SBS	Chr1	17111833	G-A	HET
SBS	Chr1	21588752	G-A	HET
SBS	Chr1	25079322	G-T	Homo
SBS	Chr1	30568007	G-A	Homo
SBS	Chr1	33354477	G-A	Homo
SBS	Chr3	5812667	G-A	Homo
SBS	Chr3	8730874	G-A	Homo
SBS	Chr3	11668342	G-A	HET
SBS	Chr3	15940993	A-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g27800
SBS	Chr4	5670323	T-A	HET
SBS	Chr4	5670324	T-C	HET
SBS	Chr4	6334994	C-A	HET
SBS	Chr4	29202312	G-A	HET
SBS	Chr5	8084122	G-T	HET
SBS	Chr5	12138678	C-A	HET
SBS	Chr6	8431487	C-G	HET
SBS	Chr6	15031930	C-A	Homo
SBS	Chr6	21300989	T-C	Homo
SBS	Chr6	25463080	T-A	HET
SBS	Chr6	26020815	T-A	HET
SBS	Chr7	1110936	C-A	Homo
SBS	Chr7	6485930	C-T	HET
SBS	Chr7	21642661	C-A	HET
SBS	Chr8	6705895	G-T	HET
SBS	Chr8	20522155	G-A	HET
SBS	Chr8	20522157	T-C	HET
SBS	Chr10	1737849	C-A	HET
SBS	Chr10	7681812	G-T	HET
SBS	Chr10	11568547	G-A	HET
SBS	Chr11	5495054	G-T	HET
SBS	Chr12	11123865	G-A	HET
SBS	Chr12	14608495	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g25330
SBS	Chr12	21236693	A-C	Homo
SBS	Chr12	27207326	C-A	Homo

Deletions: 17

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	3616001	3675000	58999	6
Deletion	Chr7	3855181	3855187	6
Deletion	Chr4	4344001	4618000	273999	33
Deletion	Chr11	4588001	4690000	101999	22
Deletion	Chr4	4958227	4958531	304	LOC_Os04g09330
Deletion	Chr7	6416001	6426000	9999	LOC_Os07g11630
Deletion	Chr7	6431001	6552000	120999	17
Deletion	Chr7	6597001	6649000	51999	7
Deletion	Chr4	10074001	10229000	154999	25
Deletion	Chr7	17690462	17690464	2
Deletion	Chr6	22255013	22255020	7	LOC_Os06g37570
Deletion	Chr5	24691380	24691381	1
Deletion	Chr5	26915813	26915826	13	LOC_Os05g46460
Deletion	Chr1	26924977	26925004	27
Deletion	Chr11	28563459	28563460	1
Deletion	Chr4	35035001	35054000	18999	2
Deletion	Chr1	41733085	41733091	6

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr1	5270183	5270184	2
Insertion	Chr9	6807841	6807841	1
Insertion	Chr3	28389567	28389570	4

No Inversion

Translocations: 14

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr7	4571366	Chr5	23338672
Translocation	Chr7	4571377	Chr5	23338376
Translocation	Chr11	5085156	Chr6	30274449	LOC_Os11g09474
Translocation	Chr11	5164491	Chr4	10268697	LOC_Os11g09670
Translocation	Chr7	6126921	Chr3	22181916	2
Translocation	Chr7	6127421	Chr3	22181904	2
Translocation	Chr7	6754724	Chr4	4958962	2
Translocation	Chr7	6759666	Chr4	4344074	2
Translocation	Chr3	11117124	Chr1	17106089	2
Translocation	Chr3	11117130	Chr1	17112501	LOC_Os03g19760
Translocation	Chr4	11929140	Chr1	17112509
Translocation	Chr4	11929148	Chr1	17169105
Translocation	Chr7	19570787	Chr6	10581656	LOC_Os07g32750
Translocation	Chr6	30274447	Chr4	10297216	2

Main menu