Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 41

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	5806870	G-A	HET
SBS	Chr1	10417955	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g18520
SBS	Chr1	19106605	G-A	HET
SBS	Chr1	21442377	G-A	HET
SBS	Chr2	999902	G-A	HET
SBS	Chr2	26785269	C-G	HET
SBS	Chr2	35362089	A-G	HET
SBS	Chr3	23649476	C-T	HET
SBS	Chr4	10331655	G-A	HET
SBS	Chr4	10724103	C-T	HET
SBS	Chr4	32658651	T-G	HET
SBS	Chr5	7945916	G-A	HET
SBS	Chr5	9480055	C-T	HET
SBS	Chr5	9480056	T-A	HET
SBS	Chr5	12332959	T-C	HET
SBS	Chr5	16922039	G-T	HET
SBS	Chr6	25084358	A-G	HET
SBS	Chr7	774888	G-T	Homo
SBS	Chr7	2414296	G-C	HET
SBS	Chr7	8587210	T-G	HET
SBS	Chr7	10555321	T-A	HET
SBS	Chr7	15420530	T-C	HET
SBS	Chr7	17247534	T-C	HET
SBS	Chr8	529976	G-A	HET
SBS	Chr8	17072143	T-C	HET
SBS	Chr8	23604172	G-T	HET
SBS	Chr8	23862013	G-T	HET
SBS	Chr8	23862015	A-T	HET
SBS	Chr8	24169046	C-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g38160
SBS	Chr8	24630570	C-T	HET
SBS	Chr9	865209	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g02190
SBS	Chr9	1846496	G-T	HET
SBS	Chr9	2992485	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g06360
SBS	Chr9	8567438	G-C	HET
SBS	Chr9	11507216	A-G	HET
SBS	Chr10	3329409	C-T	Homo
SBS	Chr10	17209952	A-T	HET
SBS	Chr11	10470149	A-G	HET
SBS	Chr12	13565527	C-T	HET
SBS	Chr12	13565528	A-T	HET
SBS	Chr12	19390573	G-T	HET

Deletions: 22

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr10	161688	161689	1
Deletion	Chr4	573626	573628	2
Deletion	Chr12	4320781	4320782	1
Deletion	Chr12	5202193	5202212	19
Deletion	Chr5	8864001	8895000	30999	9
Deletion	Chr5	8996001	9118000	121999	18
Deletion	Chr5	9125001	9479000	353999	53
Deletion	Chr8	11855035	11855037	2
Deletion	Chr6	12040644	12040645	1
Deletion	Chr2	12986690	12986702	12
Deletion	Chr9	13508647	13508655	8	LOC_Os09g22350
Deletion	Chr12	14544823	14544824	1
Deletion	Chr6	15437108	15437262	154
Deletion	Chr8	16183431	16183437	6
Deletion	Chr6	16809159	16809161	2
Deletion	Chr9	19204018	19204022	4
Deletion	Chr4	20431631	20431637	6
Deletion	Chr7	22273859	22273863	4
Deletion	Chr5	29119411	29119412	1
Deletion	Chr4	30751417	30751418	1	LOC_Os04g51860
Deletion	Chr4	33327218	33327220	2
Deletion	Chr1	36286687	36286698	11

Insertions: 1

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr10	17926105	17926107	3

Inversions: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr5	8895429	9478845

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr12	8980237	Chr2	23246110
Translocation	Chr8	17990054	Chr2	32007572
Translocation	Chr6	20502510	Chr1	11599826	LOC_Os06g35170
Translocation	Chr4	33112140	Chr2	8783449	LOC_Os04g55620

Main menu