Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 48

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	9590198	C-T	HET
SBS	Chr1	14437692	G-C	HET
SBS	Chr1	15868687	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g28330
SBS	Chr1	43100387	C-T	Homo
SBS	Chr2	1944533	A-G	HET
SBS	Chr2	1970278	C-T	HET
SBS	Chr2	31874470	G-C	HET
SBS	Chr3	1383785	A-G	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g03240
SBS	Chr3	16176870	G-C	HET
SBS	Chr4	1603766	G-A	HET
SBS	Chr4	7262068	C-T	Homo
SBS	Chr4	25099813	T-A	HET
SBS	Chr4	25736485	G-C	HET
SBS	Chr5	1638972	G-A	HET
SBS	Chr5	10402377	G-T	HET
SBS	Chr5	27248037	T-A	Homo
SBS	Chr6	13155201	G-A	HET
SBS	Chr6	13662313	G-T	HET
SBS	Chr6	16087209	G-A	HET
SBS	Chr6	29960994	A-G	Homo
SBS	Chr6	30421312	G-A	HET
SBS	Chr6	31207358	A-G	Homo
SBS	Chr7	13578981	T-C	Homo
SBS	Chr7	15079018	G-A	HET
SBS	Chr7	15336150	A-T	Homo
SBS	Chr7	15428325	T-A	Homo
SBS	Chr7	16794992	G-A	Homo
SBS	Chr7	18157010	G-A	HET
SBS	Chr7	29381667	A-G	HET
SBS	Chr8	7980855	T-C	Homo
SBS	Chr8	19835415	T-C	Homo
SBS	Chr9	13363862	C-T	HET
SBS	Chr9	21585167	C-A	Homo
SBS	Chr10	9972147	A-T	HET
SBS	Chr10	12102090	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g23190
SBS	Chr10	18550910	C-T	Homo
SBS	Chr10	19663763	G-A	Homo
SBS	Chr10	19790729	G-T	Homo
SBS	Chr11	5843012	G-A	HET
SBS	Chr11	8617088	C-T	HET
SBS	Chr11	19055260	G-A	Homo
SBS	Chr11	25145501	A-G	HET
SBS	Chr12	4601506	G-A	HET
SBS	Chr12	8072219	A-T	HET
SBS	Chr12	8072224	T-A	HET
SBS	Chr12	8961526	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g15680
SBS	Chr12	19061786	C-T	HET
SBS	Chr12	27139688	G-A	HET

Deletions: 26

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr4	2440021	2440022	1
Deletion	Chr10	3662528	3662535	7
Deletion	Chr7	3791409	3791421	12
Deletion	Chr10	6850713	6850714	1
Deletion	Chr10	7145144	7145145	1
Deletion	Chr2	7237065	7237066	1
Deletion	Chr12	7581226	7581227	1
Deletion	Chr7	11438518	11438528	10
Deletion	Chr11	14765025	14765026	1
Deletion	Chr6	14939608	14939611	3	LOC_Os06g25550
Deletion	Chr7	15495001	15545000	49999	6
Deletion	Chr6	15557069	15557072	3	LOC_Os06g27480
Deletion	Chr7	16342973	16342979	6
Deletion	Chr6	16930105	16930106	1
Deletion	Chr9	18909839	18909840	1
Deletion	Chr1	19235984	19235985	1
Deletion	Chr6	19359422	19359429	7
Deletion	Chr5	24439217	24439226	9
Deletion	Chr7	24624194	24624201	7	LOC_Os07g41140
Deletion	Chr6	25457261	25457270	9
Deletion	Chr7	25591487	25591495	8
Deletion	Chr12	25965951	25965956	5
Deletion	Chr5	26834717	26834725	8
Deletion	Chr5	27245779	27245798	19	LOC_Os05g47560
Deletion	Chr1	27480288	27480297	9
Deletion	Chr1	36315307	36315308	1	LOC_Os01g62710

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr1	3723994	3723995	2
Insertion	Chr5	29949779	29949785	7
Insertion	Chr9	2246368	2246372	5

No Inversion

Translocations: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr8	6075075	Chr5	8208599	2

Main menu