Search Results

Mutant Information

Mutant Name	FN2630-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN2630-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]
Mapping (Hover to Zoom-In)

Variant Information

Single base substitutions: 75

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	623728	C-T	HET
SBS	Chr1	647936	C-T	HET
SBS	Chr1	4022291	A-G	HET
SBS	Chr1	12514677	G-C	HET
SBS	Chr1	22105790	A-T	HET
SBS	Chr1	26203968	C-A	HET
SBS	Chr1	30107838	A-G	HET
SBS	Chr1	40220298	A-G	HET
SBS	Chr2	609354	T-A	HET
SBS	Chr2	3320710	A-G	HET
SBS	Chr2	3531828	C-T	Homo
SBS	Chr2	4555648	C-T	HET
SBS	Chr2	4555649	T-C	HET
SBS	Chr2	32383759	G-A	HET
SBS	Chr3	3352594	C-T	HET
SBS	Chr3	4031270	G-A	HET
SBS	Chr3	4137504	T-C	HET
SBS	Chr3	21353122	C-T	HET
SBS	Chr3	23057588	C-T	HET
SBS	Chr3	33865469	C-T	HET
SBS	Chr4	2382276	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g04940
SBS	Chr4	5796294	G-T	HET
SBS	Chr4	15399843	G-A	HET
SBS	Chr4	19627165	G-T	HET
SBS	Chr4	24425535	C-T	HET
SBS	Chr4	31659484	C-T	HET
SBS	Chr5	2746310	C-T	HET
SBS	Chr5	5757973	G-A	HET
SBS	Chr5	6666754	T-C	Homo
SBS	Chr5	14023639	T-A	Homo
SBS	Chr5	15549114	T-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g26810
SBS	Chr5	16056143	G-A	Homo
SBS	Chr5	22907612	G-C	HET
SBS	Chr5	26912145	A-T	HET
SBS	Chr6	11674405	G-A	HET
SBS	Chr6	14042607	A-T	HET
SBS	Chr6	15776194	C-A	HET	SPLICE_SITE_ACCEPTOR	LOC_Os06g27840
SBS	Chr6	20183198	T-C	HET
SBS	Chr6	29545933	T-A	HET
SBS	Chr6	29570307	G-A	HET
SBS	Chr7	3142522	G-T	HET
SBS	Chr7	9417471	G-A	HET
SBS	Chr7	10664355	A-C	HET
SBS	Chr7	18804413	G-A	HET
SBS	Chr7	25482312	A-T	HET
SBS	Chr7	26906545	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g45074
SBS	Chr8	2717474	C-T	HET
SBS	Chr8	9496623	G-A	HET
SBS	Chr8	18553728	A-T	HET
SBS	Chr8	27117784	C-T	HET
SBS	Chr9	10161684	A-G	HET
SBS	Chr9	15329565	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g25550
SBS	Chr9	16313343	G-A	HET
SBS	Chr9	20166261	A-G	HET
SBS	Chr10	4825522	G-A	Homo
SBS	Chr10	9798698	G-A	HET
SBS	Chr10	11988911	A-G	HET
SBS	Chr10	12390851	G-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g24190
SBS	Chr10	14311684	G-T	HET
SBS	Chr11	3802699	A-G	HET
SBS	Chr11	9824747	C-T	Homo
SBS	Chr11	10763969	C-T	Homo
SBS	Chr11	17163887	G-T	HET
SBS	Chr11	18635819	G-A	HET
SBS	Chr11	25401683	C-A	HET
SBS	Chr11	25734078	G-A	HET
SBS	Chr12	4252596	G-T	HET
SBS	Chr12	4876396	C-A	HET
SBS	Chr12	7268966	A-T	HET
SBS	Chr12	7268967	A-T	HET
SBS	Chr12	9227743	C-T	HET
SBS	Chr12	13977069	G-A	HET
SBS	Chr12	14516546	T-A	HET
SBS	Chr12	18428022	C-T	HET
SBS	Chr12	26722973	A-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g43020

Deletions: 8

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	226001	226002	1
Deletion	Chr12	4655599	4655605	6
Deletion	Chr1	10755001	10780000	24999	3
Deletion	Chr1	10875831	10875836	5	LOC_Os01g19230
Deletion	Chr11	16398310	16398318	8
Deletion	Chr5	23789206	23789208	2	LOC_Os05g40510
Deletion	Chr1	34853614	34853616	2
Deletion	Chr1	40431009	40431011	2

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr3	30030650	30030651	2
Insertion	Chr4	14748003	14748004	2

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr6	6987249	7095975	2
Inversion	Chr6	6987254	7095995	2

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr6	7481226	Chr1	35363150	2
Translocation	Chr7	10938008	Chr2	12124881
Translocation	Chr11	16669842	Chr7	28487475
Translocation	Chr11	18681519	Chr6	7481285	2

Main menu

You are here

Search Results