Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 47

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	2955991	A-C	HET
SBS	Chr1	6508286	T-A	Homo
SBS	Chr1	8864873	C-G	Homo
SBS	Chr1	9261962	C-G	HET
SBS	Chr1	12868956	T-A	HET
SBS	Chr1	21506274	G-A	HET
SBS	Chr1	28883073	G-T	HET
SBS	Chr1	33187176	T-C	Homo
SBS	Chr1	40765143	C-T	Homo
SBS	Chr2	5517386	G-T	HET
SBS	Chr2	10743652	T-C	HET
SBS	Chr2	27589050	T-A	Homo
SBS	Chr3	8607277	T-C	HET
SBS	Chr3	13142692	G-A	HET
SBS	Chr3	13731217	C-T	HET
SBS	Chr3	14345554	A-G	Homo
SBS	Chr3	14489674	C-T	HET
SBS	Chr3	16667504	A-G	HET
SBS	Chr3	19872110	G-T	HET
SBS	Chr3	19872111	G-T	HET
SBS	Chr3	35080943	A-G	HET
SBS	Chr4	1455549	C-G	HET
SBS	Chr4	2560312	C-G	HET
SBS	Chr4	12728899	G-C	Homo
SBS	Chr4	16986652	G-T	HET
SBS	Chr4	19342479	T-C	HET
SBS	Chr4	34028171	G-T	HET
SBS	Chr5	7827440	G-A	HET
SBS	Chr5	9878295	C-T	HET
SBS	Chr5	11075749	T-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g19080
SBS	Chr5	27856343	G-T	HET
SBS	Chr5	28813197	A-T	HET
SBS	Chr6	12229894	C-T	HET
SBS	Chr6	13889185	C-A	HET
SBS	Chr6	15218204	T-A	HET
SBS	Chr6	23826380	C-G	Homo
SBS	Chr7	7016763	A-T	HET	STOP_GAINED	LOC_Os07g12360
SBS	Chr7	21945609	C-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g36670
SBS	Chr8	4982367	G-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g08610
SBS	Chr8	23691729	T-C	HET
SBS	Chr9	950388	C-T	HET
SBS	Chr9	8846221	C-T	HET
SBS	Chr9	22688211	C-T	HET
SBS	Chr10	4979115	C-T	Homo
SBS	Chr11	13326442	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g23160
SBS	Chr12	4151183	C-T	Homo
SBS	Chr12	8985361	T-C	HET

Deletions: 15

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	7970218	7970227	9
Deletion	Chr2	9323001	9345000	21999	3
Deletion	Chr5	10303904	10303907	3
Deletion	Chr8	11631622	11631623	1
Deletion	Chr11	17839495	17839500	5
Deletion	Chr5	19476379	19476381	2
Deletion	Chr4	19652932	19652933	1	LOC_Os04g32620
Deletion	Chr5	21515645	21515668	23
Deletion	Chr11	25434063	25434065	2	LOC_Os11g42220
Deletion	Chr11	27051931	27051941	10
Deletion	Chr7	29469001	29484000	14999	3
Deletion	Chr6	30289670	30289679	9	LOC_Os06g50020
Deletion	Chr3	32633507	32633508	1
Deletion	Chr1	33629398	33629414	16
Deletion	Chr1	38466792	38466796	4

Insertions: 1

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr10	2493505	2493505	1

Inversions: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr10	4252605	4859071	2
Inversion	Chr10	4252612	4859072	2
Inversion	Chr2	21468724	21543562	LOC_Os02g35730
Inversion	Chr2	21468762	21543570	LOC_Os02g35730
Inversion	Chr9	22684837	22820211	LOC_Os09g39462

Translocations: 9

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr10	11201695	Chr7	29470976	2
Translocation	Chr10	11201699	Chr7	29470388	2
Translocation	Chr8	17299160	Chr4	18885956	LOC_Os08g28350
Translocation	Chr6	21950536	Chr1	13413503
Translocation	Chr9	22678017	Chr1	43247794	2
Translocation	Chr9	22684825	Chr7	29470387	2
Translocation	Chr9	22820211	Chr1	43247741	2
Translocation	Chr4	25990483	Chr2	26794030	LOC_Os04g43880
Translocation	Chr11	27688464	Chr5	23584155	2

Main menu