Search Results

Mutant Information

Mutant Name	FN2673-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN2673-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]
Mapping (Hover to Zoom-In)

Variant Information

Single base substitutions: 83

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	9644959	C-G	HET
SBS	Chr1	20013569	A-G	HET
SBS	Chr1	21867715	G-A	Homo
SBS	Chr1	22375233	G-T	HET
SBS	Chr1	22924920	G-A	Homo
SBS	Chr1	33081710	A-G	HET
SBS	Chr1	38836741	T-A	HET
SBS	Chr2	115824	A-T	HET
SBS	Chr2	192402	G-T	HET
SBS	Chr2	1204777	G-A	HET
SBS	Chr2	3504081	G-A	HET
SBS	Chr2	7579652	T-A	HET
SBS	Chr2	7980098	G-A	Homo
SBS	Chr2	21085746	G-A	HET
SBS	Chr2	33207398	T-A	Homo
SBS	Chr2	34363712	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g56170
SBS	Chr3	6211312	T-C	Homo
SBS	Chr3	11677125	C-T	HET
SBS	Chr3	12725963	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g22190
SBS	Chr3	14022876	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g24620
SBS	Chr3	17122078	C-T	HET
SBS	Chr3	19046902	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g33300
SBS	Chr3	19085781	T-C	HET
SBS	Chr3	22486977	G-C	HET
SBS	Chr3	23303767	T-C	HET
SBS	Chr3	26064342	A-T	HET
SBS	Chr3	27700727	A-T	HET
SBS	Chr3	28831727	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g50500
SBS	Chr3	29269178	T-A	HET
SBS	Chr3	29269204	C-T	HET
SBS	Chr3	33274291	A-G	HET
SBS	Chr4	6624937	C-T	HET
SBS	Chr4	13082613	G-A	HET
SBS	Chr4	21589457	G-A	HET
SBS	Chr4	23677604	C-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os04g39730
SBS	Chr4	23695555	G-A	HET
SBS	Chr4	26239678	A-T	Homo
SBS	Chr4	28545761	A-T	HET
SBS	Chr4	33216957	G-A	HET
SBS	Chr5	3434030	T-C	HET
SBS	Chr5	4549729	G-A	HET
SBS	Chr5	5790095	G-T	HET
SBS	Chr5	7956566	A-G	HET
SBS	Chr5	11506852	G-T	HET
SBS	Chr5	17284382	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g29870
SBS	Chr5	18221682	T-C	Homo
SBS	Chr5	19061077	A-G	HET
SBS	Chr5	19130123	C-T	HET
SBS	Chr5	20202865	A-G	HET
SBS	Chr5	22654220	C-T	HET
SBS	Chr6	10831119	G-A	HET
SBS	Chr6	13924830	T-C	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g23820
SBS	Chr6	30235925	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g49940
SBS	Chr7	316921	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g01500
SBS	Chr7	1458235	C-T	Homo
SBS	Chr7	10938553	T-A	Homo
SBS	Chr7	12300123	C-T	HET
SBS	Chr7	14292636	G-T	HET
SBS	Chr8	4049873	G-A	HET
SBS	Chr8	4211352	T-A	HET
SBS	Chr8	11749591	C-T	Homo
SBS	Chr8	18701274	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g30400
SBS	Chr8	20397858	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g32890
SBS	Chr8	25376111	A-G	Homo
SBS	Chr9	1069589	C-G	HET
SBS	Chr9	2121420	A-G	HET
SBS	Chr9	8378227	T-C	HET
SBS	Chr9	11242411	G-A	HET
SBS	Chr9	21034729	T-C	HET
SBS	Chr9	22784991	G-T	HET
SBS	Chr10	9510491	T-C	Homo
SBS	Chr11	1392160	G-T	HET
SBS	Chr11	4563823	C-T	HET
SBS	Chr11	4730273	G-A	HET
SBS	Chr11	8352051	T-C	HET
SBS	Chr11	15112535	G-T	HET
SBS	Chr11	22950737	G-A	HET
SBS	Chr11	25350641	A-G	HET
SBS	Chr11	28681757	G-A	HET
SBS	Chr12	1019773	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g02840
SBS	Chr12	8150775	G-A	HET
SBS	Chr12	9083682	C-G	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g15930
SBS	Chr12	17227670	C-A	HET

Deletions: 20

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr4	2594877	2594881	4	LOC_Os04g05200
Deletion	Chr11	2983758	2983764	6	LOC_Os11g06234
Deletion	Chr8	5515735	5515747	12
Deletion	Chr10	7345299	7345307	8
Deletion	Chr12	9762954	9762956	2
Deletion	Chr7	10911001	10937000	25999	3
Deletion	Chr5	11565505	11565507	2
Deletion	Chr11	12578428	12578435	7	LOC_Os11g21910
Deletion	Chr7	12629799	12629828	29
Deletion	Chr2	15668934	15668973	39
Deletion	Chr10	15874500	15874503	3	LOC_Os10g30530
Deletion	Chr10	16109107	16109112	5
Deletion	Chr11	18939463	18939464	1
Deletion	Chr11	19896546	19896567	21
Deletion	Chr9	21770867	21770868	1
Deletion	Chr1	23862903	23863398	495
Deletion	Chr8	25407453	25407454	1
Deletion	Chr6	25969971	25969983	12
Deletion	Chr3	28176711	28176713	2
Deletion	Chr11	28591618	28591619	1

Insertions: 7

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	4874203	4874203	1
Insertion	Chr3	32641582	32641583	2
Insertion	Chr4	5677293	5677296	4
Insertion	Chr4	3694899	3694902	4	LOC_Os04g07060
Insertion	Chr6	8810277	8810277	1
Insertion	Chr6	15437370	15437370	1
Insertion	Chr7	7882486	7882486	1

Inversions: 7

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr5	10236220	11186751
Inversion	Chr5	10236244	11186758
Inversion	Chr11	13402258	13600327	2
Inversion	Chr9	20806347	21034355	2
Inversion	Chr9	20806354	21034366	2
Inversion	Chr1	37898567	38366886
Inversion	Chr1	37898582	38366905

Translocations: 43

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr2	2377045	Chr1	2332548
Translocation	Chr12	2966113	Chr2	3277505	LOC_Os12g06230
Translocation	Chr11	3435412	Chr1	30237026
Translocation	Chr8	4172940	Chr6	7544380	LOC_Os08g07430
Translocation	Chr6	4273614	Chr3	27840704
Translocation	Chr11	5027349	Chr1	3456694	2
Translocation	Chr9	6282553	Chr4	5870526
Translocation	Chr12	6457494	Chr4	2769002
Translocation	Chr11	6551189	Chr3	21439963
Translocation	Chr11	6668152	Chr7	958499	2
Translocation	Chr10	8207628	Chr7	11938715	2
Translocation	Chr9	9104328	Chr4	17791425	2
Translocation	Chr9	9116870	Chr8	16818357
Translocation	Chr6	9219394	Chr3	14907255
Translocation	Chr12	9955132	Chr1	39125737
Translocation	Chr9	10934374	Chr1	8783442
Translocation	Chr8	11520560	Chr2	35304210	2
Translocation	Chr7	11938655	Chr1	16975542	LOC_Os07g20670
Translocation	Chr7	11938723	Chr2	13600035	LOC_Os07g20670
Translocation	Chr4	12370201	Chr2	25329650	2
Translocation	Chr7	13573678	Chr5	12627012	2
Translocation	Chr10	15469240	Chr2	26917497	2
Translocation	Chr8	15765976	Chr3	15248051	2
Translocation	Chr2	16599749	Chr1	19738564
Translocation	Chr12	16959656	Chr2	611354
Translocation	Chr7	17052497	Chr1	2773981	2
Translocation	Chr12	19090671	Chr10	1076403	LOC_Os12g31710
Translocation	Chr3	19544628	Chr1	9929654	2
Translocation	Chr9	19846048	Chr1	3204859	LOC_Os09g33610
Translocation	Chr12	20000154	Chr2	20513525
Translocation	Chr9	20294565	Chr1	33161280
Translocation	Chr7	21033253	Chr5	26268341
Translocation	Chr7	22081676	Chr4	16289132
Translocation	Chr8	22651596	Chr7	3871170	LOC_Os08g35910
Translocation	Chr8	22803825	Chr7	1478338
Translocation	Chr6	23042478	Chr3	3707349	2
Translocation	Chr12	23803489	Chr3	22076017	2
Translocation	Chr12	24279596	Chr2	26313990	2
Translocation	Chr4	25756767	Chr1	2816738
Translocation	Chr4	27248012	Chr2	24373941	2
Translocation	Chr7	28085274	Chr1	15882272
Translocation	Chr3	28718267	Chr1	18688725	2
Translocation	Chr4	32281557	Chr3	21730919	2

Main menu

You are here

Search Results