Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 53

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	10728133	G-A	HET
SBS	Chr1	14448485	A-G	HET
SBS	Chr1	23702221	G-C	HET
SBS	Chr1	24422753	G-T	HET
SBS	Chr2	2107696	C-T	HET
SBS	Chr2	10879791	G-A	Homo
SBS	Chr2	14085567	C-T	HET	STOP_GAINED	LOC_Os02g24280
SBS	Chr2	15450591	G-A	HET
SBS	Chr2	15983276	A-G	HET
SBS	Chr2	19375172	C-T	HET
SBS	Chr2	19375173	C-T	HET
SBS	Chr2	19375174	A-T	HET
SBS	Chr2	20329120	T-C	HET
SBS	Chr3	10719457	G-A	HET
SBS	Chr3	15668284	C-T	Homo
SBS	Chr3	24587646	G-A	HET
SBS	Chr3	25156189	T-C	Homo
SBS	Chr3	30840422	T-A	HET
SBS	Chr4	7600097	G-A	HET
SBS	Chr4	19019661	C-T	Homo
SBS	Chr4	28001378	T-C	HET
SBS	Chr5	9678586	G-T	Homo
SBS	Chr5	16749529	A-T	Homo
SBS	Chr5	25409108	C-A	HET
SBS	Chr5	25940094	T-C	HET
SBS	Chr5	29437539	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g51320
SBS	Chr6	7523370	T-A	HET
SBS	Chr6	19781793	G-C	Homo
SBS	Chr6	26029429	C-T	Homo
SBS	Chr7	646099	A-G	HET
SBS	Chr7	5637561	T-C	HET
SBS	Chr7	17022881	T-A	HET
SBS	Chr7	17058267	A-G	HET
SBS	Chr7	17326597	T-A	HET
SBS	Chr7	21735227	T-A	HET
SBS	Chr7	22182188	G-A	HET
SBS	Chr7	23386323	G-A	HET
SBS	Chr8	6533239	A-G	Homo
SBS	Chr8	6932696	T-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os08g11820
SBS	Chr8	13746290	A-G	Homo
SBS	Chr8	23922338	T-A	HET
SBS	Chr8	24936823	G-T	HET
SBS	Chr9	3880192	C-T	Homo
SBS	Chr10	1137859	A-T	Homo
SBS	Chr10	2555108	C-T	HET
SBS	Chr10	7091345	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g12710
SBS	Chr10	20779269	C-T	HET
SBS	Chr10	21822029	T-G	HET
SBS	Chr11	12009850	C-T	HET
SBS	Chr11	15287145	C-T	HET
SBS	Chr11	15287148	C-G	HET
SBS	Chr12	1429708	A-G	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g03570
SBS	Chr12	19825173	G-A	Homo

Deletions: 17

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr6	1757430	1757437	7
Deletion	Chr10	2038263	2038264	1
Deletion	Chr2	2309522	2309528	6
Deletion	Chr8	2609267	2609271	4	LOC_Os08g05070
Deletion	Chr5	3850305	3850319	14
Deletion	Chr3	5766331	5766332	1
Deletion	Chr2	5857031	5857037	6
Deletion	Chr1	7819042	7819045	3
Deletion	Chr1	10098199	10098202	3
Deletion	Chr8	13702902	13702905	3
Deletion	Chr7	15413976	15413984	8
Deletion	Chr11	20987460	20987461	1
Deletion	Chr12	24958746	24958751	5
Deletion	Chr12	26070903	26070927	24
Deletion	Chr5	26745802	26745810	8
Deletion	Chr6	30381556	30381571	15
Deletion	Chr1	30721042	30721065	23	LOC_Os01g53480

Insertions: 4

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr2	7936310	7936311	2
Insertion	Chr5	29432416	29432416	1
Insertion	Chr10	7020023	7020025	3
Insertion	Chr12	27440373	27440374	2

Inversions: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	21098657	21129593

Translocations: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr9	13031352	Chr1	3901421	2
Translocation	Chr9	13035694	Chr1	3901409	2
Translocation	Chr9	14631906	Chr2	13506474	2
Translocation	Chr9	14632351	Chr2	13506462	2
Translocation	Chr11	21306932	Chr10	6721200	2

Main menu