Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 46

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	11052413	C-T	HET
SBS	Chr1	18781996	A-T	HET
SBS	Chr1	20721164	A-G	HET
SBS	Chr1	21029436	G-A	HET
SBS	Chr1	22635534	T-A	HET
SBS	Chr2	4701108	T-A	Homo
SBS	Chr2	5999646	G-A	HET
SBS	Chr2	8759141	A-T	HET
SBS	Chr2	9925966	C-T	HET
SBS	Chr2	9925968	A-T	HET
SBS	Chr2	12670509	A-T	HET
SBS	Chr2	17390621	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g29270
SBS	Chr2	26528761	C-T	HET
SBS	Chr3	1368068	C-T	HET
SBS	Chr3	4194344	T-A	HET
SBS	Chr3	18006140	A-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g31560
SBS	Chr3	18837799	C-T	HET
SBS	Chr3	29557725	T-G	HET
SBS	Chr4	10134864	G-T	HET
SBS	Chr4	10193667	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g18460
SBS	Chr4	11104468	G-A	HET
SBS	Chr4	16812167	C-A	HET
SBS	Chr5	15990453	G-T	HET
SBS	Chr5	18358807	T-C	HET
SBS	Chr5	21571054	G-A	HET
SBS	Chr5	23156941	G-A	HET
SBS	Chr6	7605253	C-T	HET
SBS	Chr6	25878399	T-A	HET
SBS	Chr7	8550464	G-A	HET
SBS	Chr7	17906514	T-C	HET
SBS	Chr7	23299117	C-T	HET
SBS	Chr7	23646806	C-A	HET
SBS	Chr7	26783315	A-T	HET
SBS	Chr8	14614872	A-G	HET
SBS	Chr8	26412932	T-C	HET
SBS	Chr8	28054027	A-G	HET
SBS	Chr9	6425151	G-C	HET
SBS	Chr9	11964566	G-A	HET
SBS	Chr10	3671057	A-G	HET
SBS	Chr10	9802256	T-A	HET
SBS	Chr10	22275508	T-C	HET
SBS	Chr12	9590770	G-A	HET
SBS	Chr12	13537426	C-T	Homo
SBS	Chr12	17924485	A-C	HET
SBS	Chr12	19152912	G-C	HET
SBS	Chr12	22557341	C-T	HET

Deletions: 14

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr8	218732	218741	9
Deletion	Chr10	618571	618577	6
Deletion	Chr1	859508	859511	3	LOC_Os01g02580
Deletion	Chr4	1584047	1584048	1
Deletion	Chr3	6391001	6415000	23999	6
Deletion	Chr8	7824597	7824605	8
Deletion	Chr12	12664001	12872000	207999	37
Deletion	Chr12	12882001	13045000	162999	22
Deletion	Chr8	13671287	13671292	5
Deletion	Chr7	16718001	16732000	13999	3
Deletion	Chr7	16739001	16827000	87999	17
Deletion	Chr3	17680001	17703000	22999	3
Deletion	Chr5	18355476	18355484	8	LOC_Os05g31550
Deletion	Chr8	20978528	20978532	4

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr1	29606571	29606572	2
Insertion	Chr5	311092	311093	2
Insertion	Chr12	1645515	1645516	2

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr9	8615574	8615975	LOC_Os09g14550
Inversion	Chr7	16737231	16742578

Translocations: 9

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr5	12724559	Chr4	14980018
Translocation	Chr10	16410554	Chr7	25006271	LOC_Os10g31290
Translocation	Chr10	16410880	Chr7	25006275	LOC_Os10g31290
Translocation	Chr7	16731026	Chr4	22004519	LOC_Os07g28590
Translocation	Chr7	16731507	Chr4	22004495	LOC_Os07g28590
Translocation	Chr9	20449158	Chr4	10160156	2
Translocation	Chr12	21957031	Chr7	16820887	2
Translocation	Chr12	21957484	Chr7	16718400
Translocation	Chr12	25023683	Chr7	16731523	2

Main menu