Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 48

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3670591	G-C	HET
SBS	Chr1	6508172	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g11952
SBS	Chr1	7132307	G-T	HET
SBS	Chr1	21436772	C-T	HET
SBS	Chr1	42913102	C-T	HET
SBS	Chr2	3346723	T-A	HET
SBS	Chr2	7455386	G-A	HET
SBS	Chr2	17046560	A-G	HET
SBS	Chr2	22209188	G-T	HET
SBS	Chr3	5201873	C-A	HET
SBS	Chr3	13788612	A-G	HET
SBS	Chr3	14540190	C-T	HET
SBS	Chr3	23612071	G-A	HET
SBS	Chr3	32732401	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g57400
SBS	Chr4	1223030	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g03000
SBS	Chr4	1517874	A-G	HET
SBS	Chr4	2601822	C-T	HET
SBS	Chr4	5486302	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g10160
SBS	Chr4	6545209	G-A	HET
SBS	Chr4	10560549	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g19000
SBS	Chr4	16107307	A-G	HET
SBS	Chr5	5903966	G-A	HET
SBS	Chr5	5903973	G-C	HET
SBS	Chr5	7783236	C-T	HET
SBS	Chr5	9181951	T-A	HET
SBS	Chr5	18313228	T-A	Homo
SBS	Chr5	26328883	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g45380
SBS	Chr6	9736108	G-A	HET
SBS	Chr6	9736110	C-T	HET
SBS	Chr6	14262516	T-A	HET
SBS	Chr6	15645443	G-A	HET
SBS	Chr6	16595162	G-A	HET
SBS	Chr6	28561850	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g47130
SBS	Chr7	17055318	T-C	HET
SBS	Chr7	22831816	T-C	HET
SBS	Chr8	11633139	A-G	HET
SBS	Chr8	25195036	A-T	Homo
SBS	Chr8	25195037	C-G	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g39810
SBS	Chr9	11760160	T-C	HET
SBS	Chr9	15492382	C-T	HET
SBS	Chr9	19652745	C-T	HET
SBS	Chr9	22414570	G-T	HET
SBS	Chr10	6398993	G-A	HET
SBS	Chr11	3563302	G-A	HET
SBS	Chr11	3694145	T-A	HET
SBS	Chr12	1008619	T-A	HET
SBS	Chr12	5322036	A-T	HET
SBS	Chr12	8225166	A-G	HET

Deletions: 8

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr2	1534001	1572000	37999	9
Deletion	Chr5	5695001	5900000	204999	26
Deletion	Chr5	6432001	7071000	638999	86
Deletion	Chr3	15022558	15022571	13	LOC_Os03g26260
Deletion	Chr10	17995540	17995544	4
Deletion	Chr6	21610001	21641000	30999	4
Deletion	Chr1	23841417	23841431	14
Deletion	Chr8	24110152	24110165	13

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr6	28607046	28607185	140
Insertion	Chr8	21890634	21890634	1

Inversions: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr5	5658200	5692975	2
Inversion	Chr5	5658208	5903155	LOC_Os05g10380
Inversion	Chr1	19468120	19683897	2
Inversion	Chr12	26566014	26684861	LOC_Os12g42950
Inversion	Chr12	26566060	26684888	LOC_Os12g42950

Translocations: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr4	4265149	Chr3	24861154	LOC_Os03g44240
Translocation	Chr9	4453214	Chr8	19754312
Translocation	Chr5	9870527	Chr4	15936440
Translocation	Chr8	25164756	Chr4	18033538
Translocation	Chr8	25165494	Chr2	27987816	LOC_Os02g45920

Main menu