Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 32

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	669550	C-T	HET
SBS	Chr1	669551	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g02230
SBS	Chr1	3498319	A-T	HET
SBS	Chr1	18016373	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g32830
SBS	Chr1	18062517	T-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os01g32890
SBS	Chr1	25808304	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g45490
SBS	Chr1	39554923	C-A	HET
SBS	Chr1	39554925	G-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g68040
SBS	Chr2	13526401	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os02g22700
SBS	Chr3	25577455	C-T	Homo
SBS	Chr3	27746200	C-T	Homo	STOP_GAINED	LOC_Os03g48674
SBS	Chr4	6831048	G-A	HET
SBS	Chr4	18436203	G-A	HET
SBS	Chr5	4124459	G-A	HET
SBS	Chr5	8011276	C-A	HET
SBS	Chr5	8159459	T-A	Homo
SBS	Chr5	16979668	G-T	Homo
SBS	Chr6	17866371	A-G	HET
SBS	Chr6	22681695	G-A	HET
SBS	Chr7	27276651	G-A	HET
SBS	Chr8	2316747	C-T	HET
SBS	Chr8	2505043	G-T	HET
SBS	Chr8	5937785	A-G	HET
SBS	Chr8	10613327	G-A	HET
SBS	Chr8	16743012	T-A	HET
SBS	Chr8	19854187	G-A	Homo
SBS	Chr8	23716980	A-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g37432
SBS	Chr9	5985178	G-A	Homo
SBS	Chr10	10672185	G-A	Homo
SBS	Chr10	11674643	A-T	HET
SBS	Chr11	2728538	T-G	HET
SBS	Chr12	9864108	C-A	HET

Deletions: 11

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr12	3664378	3664379	1
Deletion	Chr6	3777638	3777644	6
Deletion	Chr2	3841001	3871000	29999	5
Deletion	Chr2	4108185	4108189	4
Deletion	Chr6	9917091	9917099	8
Deletion	Chr12	15051812	15051816	4
Deletion	Chr4	15978239	15978241	2
Deletion	Chr4	21893557	21893597	40
Deletion	Chr5	24386154	24386176	22
Deletion	Chr3	27446823	27446842	19
Deletion	Chr2	27869654	27869664	10

Insertions: 8

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	38086940	38086940	1
Insertion	Chr2	2106504	2106505	2
Insertion	Chr2	17459338	17459340	3
Insertion	Chr3	10129616	10129619	4
Insertion	Chr10	1054151	1054152	2
Insertion	Chr4	10299853	10299880	28
Insertion	Chr5	12714867	12714867	1
Insertion	Chr10	8733041	8733043	3	LOC_Os10g17340

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr3	18276152	18437205
Inversion	Chr1	38021357	38608168	LOC_Os01g65500
Inversion	Chr1	38021366	38608186	LOC_Os01g65500

No Translocation

Main menu