Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 54

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	20623619	T-A	HET
SBS	Chr1	21518617	G-A	Homo
SBS	Chr1	24375535	A-G	HET
SBS	Chr1	27514412	T-A	HET
SBS	Chr1	29918479	C-A	Homo
SBS	Chr1	30933008	T-G	HET
SBS	Chr1	31115885	A-T	Homo
SBS	Chr2	10442382	G-A	Homo
SBS	Chr2	27430097	T-G	HET
SBS	Chr3	9548594	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g17164
SBS	Chr3	24006530	A-C	HET
SBS	Chr3	30904914	G-C	HET
SBS	Chr3	32704677	T-C	HET
SBS	Chr4	2264621	A-T	Homo
SBS	Chr4	3034944	G-C	HET
SBS	Chr4	4784732	A-G	HET
SBS	Chr4	4882420	A-G	HET
SBS	Chr4	5751437	C-A	HET
SBS	Chr4	13446669	C-T	HET
SBS	Chr4	16308004	C-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os04g27560
SBS	Chr5	20489501	T-G	Homo
SBS	Chr5	22076579	T-A	HET
SBS	Chr6	5308305	C-G	HET
SBS	Chr6	15839476	G-A	HET
SBS	Chr6	17578178	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g30420
SBS	Chr6	31076053	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g51310
SBS	Chr7	3243281	T-A	HET
SBS	Chr7	6384986	G-A	HET
SBS	Chr7	20932247	G-A	Homo
SBS	Chr7	26139528	T-C	HET
SBS	Chr8	5229295	G-A	HET
SBS	Chr8	10737103	C-T	HET
SBS	Chr8	18606063	T-G	Homo
SBS	Chr8	22435969	G-A	HET
SBS	Chr8	22435972	G-A	HET
SBS	Chr8	28334585	A-G	Homo
SBS	Chr9	3902792	G-A	HET
SBS	Chr9	15779636	A-C	HET
SBS	Chr9	20664709	G-T	HET
SBS	Chr10	3218192	C-T	HET
SBS	Chr10	4577263	T-C	Homo
SBS	Chr10	19578756	G-A	Homo
SBS	Chr11	5162575	T-A	HET
SBS	Chr11	12790488	G-A	HET
SBS	Chr11	21439604	C-G	HET
SBS	Chr11	23237926	T-C	Homo
SBS	Chr11	24138931	T-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g40460
SBS	Chr12	951980	A-G	HET
SBS	Chr12	1671209	G-C	HET
SBS	Chr12	12832251	T-A	HET
SBS	Chr12	17698399	C-T	HET
SBS	Chr12	21952014	C-T	HET
SBS	Chr12	22828384	A-G	HET
SBS	Chr12	23625965	A-G	HET

Deletions: 8

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr2	1289698	1289699	1	LOC_Os02g03230
Deletion	Chr5	7773715	7773716	1
Deletion	Chr12	8175001	8529000	353999	47
Deletion	Chr12	8546001	8556000	9999
Deletion	Chr2	14812997	14813000	3
Deletion	Chr9	18079311	18079334	23	LOC_Os09g29730
Deletion	Chr10	18088930	18088931	1
Deletion	Chr9	21124249	21124250	1

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr4	11295488	11295489	2
Insertion	Chr1	15752577	15752581	5
Insertion	Chr3	26761919	26762300	382

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr4	28808470	28845402	LOC_Os04g48370
Inversion	Chr4	33878125	33915596
Inversion	Chr4	33878128	33915624

Translocations: 13

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr8	3240572	Chr5	8132884	LOC_Os05g14420
Translocation	Chr4	5840895	Chr2	28281115
Translocation	Chr11	7073666	Chr7	17406846	2
Translocation	Chr7	10511352	Chr3	23252800
Translocation	Chr8	16320933	Chr5	3090326	LOC_Os08g26840
Translocation	Chr4	17228964	Chr2	2392457	LOC_Os02g05030
Translocation	Chr4	17228974	Chr2	2392038	LOC_Os02g05030
Translocation	Chr6	18247541	Chr4	25155880	LOC_Os06g31350
Translocation	Chr8	18426031	Chr2	18430727	2
Translocation	Chr11	19619708	Chr4	2530360	LOC_Os04g05104
Translocation	Chr11	24830135	Chr10	20543868
Translocation	Chr8	27625769	Chr3	8424106
Translocation	Chr4	28729759	Chr1	2755001	LOC_Os01g05770

Main menu