Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 41

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	6856244	C-A	HET
SBS	Chr1	22979066	G-A	HET
SBS	Chr1	32838562	T-G	HET
SBS	Chr1	36798310	T-A	HET
SBS	Chr1	36872498	C-T	HET
SBS	Chr2	9510648	C-T	Homo
SBS	Chr2	19145830	C-G	Homo
SBS	Chr2	29029437	G-C	HET
SBS	Chr4	7758898	C-T	HET
SBS	Chr4	23119829	C-T	Homo
SBS	Chr4	34275795	G-A	Homo
SBS	Chr5	10593479	A-T	Homo
SBS	Chr5	24858416	T-C	Homo
SBS	Chr5	27666368	G-A	Homo
SBS	Chr6	11597491	A-G	Homo
SBS	Chr6	14342265	T-C	Homo
SBS	Chr6	28971360	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g47890
SBS	Chr7	9746791	A-T	HET
SBS	Chr8	166687	C-T	HET
SBS	Chr8	439060	T-A	HET
SBS	Chr8	439149	G-C	HET
SBS	Chr8	6788554	A-T	HET
SBS	Chr8	7734492	C-A	HET
SBS	Chr8	10407652	G-A	HET
SBS	Chr8	19170691	G-A	HET
SBS	Chr9	993053	T-G	HET
SBS	Chr9	11289078	T-G	HET
SBS	Chr9	13506280	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g22350
SBS	Chr9	18507200	A-C	HET
SBS	Chr9	20929367	A-G	HET
SBS	Chr10	1762827	G-A	HET
SBS	Chr10	8550580	C-T	HET
SBS	Chr10	18952166	C-T	HET
SBS	Chr10	21614262	G-A	Homo
SBS	Chr11	3865576	T-A	HET
SBS	Chr11	15801757	C-G	HET
SBS	Chr11	20818001	G-A	HET
SBS	Chr11	21326365	C-T	Homo
SBS	Chr12	9842015	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os12g17190
SBS	Chr12	18228634	G-A	HET
SBS	Chr12	21726926	G-T	HET

Deletions: 17

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr12	784116	784117	1
Deletion	Chr4	2428923	2428931	8	LOC_Os04g05010
Deletion	Chr8	5481489	5481490	1
Deletion	Chr7	5492835	5492839	4	LOC_Os07g10230
Deletion	Chr5	7773578	7773585	7
Deletion	Chr7	15253001	15306000	52999	7
Deletion	Chr12	16960001	16976000	15999	3
Deletion	Chr12	16981001	17150000	168999	26
Deletion	Chr12	17175001	17225000	49999	7
Deletion	Chr12	17231001	17285000	53999	10
Deletion	Chr12	17296001	17321000	24999	4
Deletion	Chr12	17324001	17337000	12999
Deletion	Chr12	17354001	17513000	158999	20
Deletion	Chr11	19498192	19498193	1
Deletion	Chr6	19964147	19964168	21	LOC_Os06g34320
Deletion	Chr1	26533431	26533434	3	LOC_Os01g46610
Deletion	Chr4	33496473	33496474	1

Insertions: 5

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr4	34768945	34768945	1
Insertion	Chr6	28763937	28763939	3	LOC_Os06g47510
Insertion	Chr9	19195501	19195579	79
Insertion	Chr10	8667874	8667874	1
Insertion	Chr10	21612212	21612214	3

Inversions: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr3	6823651	6823764
Inversion	Chr5	15676729	15854317	LOC_Os05g27270
Inversion	Chr6	25348030	25709116	2
Inversion	Chr6	25348042	25709124	2

Translocations: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr5	3021820	Chr1	27404635

Main menu