Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 40

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3680547	G-A	HET
SBS	Chr1	3680548	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g07640
SBS	Chr1	6816638	G-A	HET
SBS	Chr1	14748428	G-A	HET
SBS	Chr1	15775649	C-G	HET
SBS	Chr1	32570228	A-G	Homo
SBS	Chr2	487679	A-C	HET
SBS	Chr2	22685396	G-C	HET
SBS	Chr3	4767179	G-A	HET
SBS	Chr3	9307335	A-G	HET
SBS	Chr3	10142874	A-G	HET
SBS	Chr3	13565552	A-C	Homo
SBS	Chr3	36053924	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g63820
SBS	Chr4	3348562	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g06420
SBS	Chr4	3348563	C-A	HET	STOP_GAINED	LOC_Os04g06420
SBS	Chr4	14597451	T-C	HET
SBS	Chr4	34605047	T-C	HET
SBS	Chr5	21014764	G-A	HET
SBS	Chr6	4621794	C-T	HET
SBS	Chr6	15091270	A-G	HET
SBS	Chr6	24354182	C-T	HET
SBS	Chr7	14004299	G-A	HET
SBS	Chr7	14004300	C-A	HET
SBS	Chr8	1959719	G-A	Homo
SBS	Chr8	2672261	T-C	HET
SBS	Chr8	19177981	A-G	HET
SBS	Chr8	21263705	C-A	Homo
SBS	Chr9	2210687	C-T	HET
SBS	Chr9	3307228	G-A	HET
SBS	Chr9	7064965	C-T	Homo
SBS	Chr9	19047927	T-C	HET
SBS	Chr9	22558415	A-T	HET
SBS	Chr10	12101135	G-A	Homo
SBS	Chr11	963461	C-A	HET
SBS	Chr11	4069824	A-T	HET
SBS	Chr11	11802798	C-T	HET
SBS	Chr11	16376062	A-T	HET
SBS	Chr11	22087499	G-A	HET
SBS	Chr12	19760294	T-A	HET
SBS	Chr12	19760295	G-A	HET

Deletions: 26

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	1569757	1569758	1
Deletion	Chr2	2363305	2363310	5
Deletion	Chr9	2958676	2958681	5
Deletion	Chr4	3947046	3947047	1
Deletion	Chr1	4038464	4038473	9
Deletion	Chr8	5715487	5715489	2	LOC_Os08g09900
Deletion	Chr6	6511696	6511700	4
Deletion	Chr8	6774001	6805000	30999	3
Deletion	Chr2	7105001	7137000	31999	7
Deletion	Chr4	8852001	8931000	78999	13
Deletion	Chr4	8955001	8993000	37999	7
Deletion	Chr4	9004001	9023000	18999	4
Deletion	Chr4	9034001	9081000	46999	8
Deletion	Chr1	9909699	9909700	1
Deletion	Chr10	10117511	10117519	8
Deletion	Chr7	11112001	11308000	195999	28
Deletion	Chr3	12022289	12022299	10	LOC_Os03g21120
Deletion	Chr12	13729806	13729812	6
Deletion	Chr9	15700001	15728000	27999	LOC_Os09g26110
Deletion	Chr8	15735597	15735603	6
Deletion	Chr1	17764587	17764591	4	LOC_Os01g32364
Deletion	Chr6	24537399	24537400	1
Deletion	Chr11	24752001	25030000	277999	39
Deletion	Chr7	26774844	26774851	7
Deletion	Chr1	28883464	28883465	1
Deletion	Chr1	38810001	38861000	50999	7

Insertions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr3	13026848	13026849	2	LOC_Os03g22600
Insertion	Chr12	22243474	22243474	1

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr4	7197269	7209770	LOC_Os04g13050
Inversion	Chr4	7197278	7209766	LOC_Os04g13050
Inversion	Chr9	14734423	14749234

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr7	11200524	Chr3	25420903	2
Translocation	Chr12	12338603	Chr9	14749226	LOC_Os12g21910
Translocation	Chr12	12342965	Chr9	14734412
Translocation	Chr10	18308177	Chr8	6810958

Main menu