Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 49

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	11464023	A-G	Homo
SBS	Chr1	17528375	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os01g32010
SBS	Chr1	34174715	C-T	HET
SBS	Chr2	1250398	C-T	Homo
SBS	Chr2	15450838	T-C	Homo
SBS	Chr2	15741258	C-T	HET
SBS	Chr2	20667894	A-G	Homo
SBS	Chr3	765266	T-G	HET
SBS	Chr3	1210088	G-A	HET
SBS	Chr3	10515264	T-A	HET
SBS	Chr3	17944944	C-T	HET
SBS	Chr3	31599741	G-A	Homo
SBS	Chr4	3906948	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g07340
SBS	Chr5	12413389	G-A	HET
SBS	Chr5	17990575	C-A	HET
SBS	Chr6	11566260	C-A	HET
SBS	Chr6	11566262	T-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g20160
SBS	Chr6	11887287	C-G	HET
SBS	Chr6	16065622	A-T	HET
SBS	Chr7	4550551	T-C	Homo
SBS	Chr7	8046310	C-T	HET
SBS	Chr7	8046312	G-T	HET
SBS	Chr7	8617841	C-T	HET
SBS	Chr7	10213030	C-T	HET
SBS	Chr7	11884262	C-A	HET
SBS	Chr7	12609031	G-C	HET
SBS	Chr7	14419542	G-T	HET
SBS	Chr8	2218416	G-T	HET
SBS	Chr8	10359560	G-A	HET
SBS	Chr8	19440091	G-A	HET
SBS	Chr8	26597028	G-A	HET
SBS	Chr9	1176699	G-C	HET
SBS	Chr9	2992485	C-A	Homo	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g06360
SBS	Chr9	5490047	A-T	Homo
SBS	Chr9	5490495	A-T	Homo
SBS	Chr9	17311931	T-C	Homo
SBS	Chr10	1553919	A-T	HET
SBS	Chr10	15082773	G-A	HET
SBS	Chr11	10387219	C-G	HET
SBS	Chr11	12779148	A-T	HET
SBS	Chr11	13385860	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g23230
SBS	Chr11	13429686	A-G	HET
SBS	Chr11	19420512	T-A	Homo
SBS	Chr11	22270287	G-T	Homo
SBS	Chr12	1359054	C-T	HET
SBS	Chr12	2127073	G-A	HET
SBS	Chr12	4416780	A-T	HET
SBS	Chr12	23059861	G-A	HET
SBS	Chr12	24600521	T-G	Homo

Deletions: 24

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr10	74285	74287	2
Deletion	Chr10	1291001	1327000	35999	7
Deletion	Chr10	1337001	1406000	68999	16
Deletion	Chr10	1417001	1482000	64999	11
Deletion	Chr10	1492001	1531000	38999	8
Deletion	Chr10	1889773	1889778	5
Deletion	Chr5	1933447	1933448	1	LOC_Os05g04240
Deletion	Chr3	1942675	1942692	17
Deletion	Chr12	1943743	1943748	5
Deletion	Chr12	2007659	2007665	6
Deletion	Chr7	2223770	2223771	1
Deletion	Chr3	9204209	9204225	16	LOC_Os03g16670
Deletion	Chr12	10217933	10217944	11
Deletion	Chr4	10682065	10682066	1
Deletion	Chr2	11365581	11365598	17
Deletion	Chr10	12683687	12683698	11
Deletion	Chr4	14162214	14162219	5
Deletion	Chr8	16087130	16087131	1
Deletion	Chr4	17456114	17456118	4
Deletion	Chr6	20317602	20317605	3
Deletion	Chr8	24860001	24870000	9999	2
Deletion	Chr7	28766107	28766108	1	LOC_Os07g48160
Deletion	Chr3	29580045	29580046	1
Deletion	Chr4	34453136	34453142	6

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr5	20090488	20090489	2
Insertion	Chr2	7411372	7411597	226
Insertion	Chr11	25114333	25114333	1

Inversions: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr2	5653841	6109879
Inversion	Chr2	6109883	6418838	LOC_Os02g12330
Inversion	Chr9	6215673	6481937	LOC_Os09g11610
Inversion	Chr9	6215683	6481943	LOC_Os09g11610
Inversion	Chr4	14684206	15117381

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr8	24869848	Chr3	14211117	LOC_Os08g39350
Translocation	Chr8	24870165	Chr3	14211126	LOC_Os08g39350
Translocation	Chr8	24926835	Chr2	32190001	LOC_Os02g52620
Translocation	Chr8	24927128	Chr2	9936528	LOC_Os02g17320

Main menu